针对您提出的“职务侵占6000元怎么处理”的问题，我将从法律后果、处理建议以及预防措施三个方面为您详细解答。

一、法律后果

1. 刑事责任： 根据现行司法解释，职务侵占罪的入罪数额标准通常为6万元以上。因此，职务侵占6000元的行为，一般不构成职务侵占罪，不会面临刑事处罚。但需要注意的是，如果行为人有其他违法行为或情节严重，如多次侵占、手段恶劣等，仍可能受到其他相关法律的制裁。

2. 民事责任： 无论是否构成刑事犯罪，行为人都需要承担民事责任。企业或单位有权要求侵占人返还被侵占的6000元款项，并可以要求赔偿因此遭受的损失，如调查费用、经营损失等。如果双方无法协商解决，企业或单位可以向人民法院提起民事诉讼。

二、处理建议

1. 对行为人的建议：

   • 主动退赔：立即退还侵占的款项，这是减轻法律后果的关键步骤。
   • 自首与配合调查：如果行为人意识到自己的错误，应主动向单位或司法机关说明情况，并如实陈述事实，避免隐瞒或逃避责任。
   • 寻求专业帮助：咨询专业律师，了解具体的法律责任和可能的辩护策略，以便更好地应对后续的法律程序。

2. 对单位的建议：

   • 内部调查与证据收集：单位应迅速展开内部调查，收集相关证据，如财务记录、监控录像等，以便在需要时向公安机关报案或提起民事诉讼。
   • 完善管理制度：加强财务监管和审计监督，明确岗位职责权限，防止类似事件再次发生。
   • 开展法治教育：通过培训、案例分享等方式提升员工的法律意识，营造诚信的职场环境。

三、预防措施

1. 强化内部控制：

   • 实施岗位分离制度，确保审批与执行等关键环节相互独立。
   • 定期轮岗并强制休假，减少员工长期侵占的机会。

2. 建立监督机制：

   • 设立独立审计部门或聘请外部机构定期审查账目，确保财务透明。
   • 开通匿名举报渠道，鼓励员工积极参与监督，及时发现并纠正违规行为。

3. 完善合同管理：

   • 规范印章使用流程，防止伪造合同侵占资产。
   • 对大额交易实施多级审批制度，确保交易合规性。

4. 加强法治宣传：

   • 通过案例分享会、法律知识竞赛等形式普及职务侵占相关法律知识，提高员工的法律意识和风险防范能力。

总结： 职务侵占6000元虽然不构成职务侵占罪，但仍需承担民事责任并可能面临单位内部的纪律处分。行为人应主动退赔、自首并配合调查，以减轻法律后果；单位则应加强内部管理、完善规章制度并开展法治教育，以防范类似事件的再次发生。双方均需强化法律意识，共同维护职场诚信环境。如需更准确的信息或法律帮助，请咨询当地专业律师。