结论：公司加班超过36小时是否违法，需结合具体情况和相关法律规定来判断。在一般情况下，公司加班超过36小时是违法的；但在特定的特殊情况下，如紧急处理、公共设施抢修等，加班时间可能不受此限制。以下是对这一问题的详细分析：

一、一般情况下的加班规定

根据《中华人民共和国劳动法》第四十一条的规定，用人单位因生产经营需要，经与工会和劳动者协商后，可以延长工作时间。但延长的工作时间有严格限制：

• 一般每日不得超过一小时；
• 在特殊原因下，且需保障劳动者身体健康的条件下，延长工作时间每日不得超过三小时；
• 每月累计不得超过三十六小时。

在常规情况下，如果公司安排的加班时间超过每月36小时，即构成违反劳动法的行为。对于用人单位的违法行为，劳动者有权向劳动行政部门投诉。劳动行政部门将依法给予警告，责令限期改正，并可按照受侵害的劳动者每人100元以上500元以下的标准处以罚款。

二、特殊情况下的加班豁免

然而，法律也考虑到了一些特殊情况，允许在这些情况下加班时间超过每月36小时的限制。根据《中华人民共和国劳动法》第四十二条的规定，以下情形不受上述加班时间的限制：

1. 紧急处理情况：发生自然灾害、事故或其他威胁劳动者生命健康和财产安全的情况，需要紧急处理的。例如，地震、洪水等自然灾害发生时，相关救援单位和人员需要加班加点进行抢险救灾工作。
2. 公共设施抢修：生产设备、交通运输线路、公共设施发生故障，影响生产和公众利益，必须及时抢修的。如城市供水管道破裂，维修人员需加班抢修以保障正常供水。
3. 其他法定情形：法律、行政法规规定的其他特殊情形，作为兜底条款以适应可能出现的其他紧急情况。

在这些特殊情况下，虽然加班时间可能超出法定限制，但用人单位仍应确保劳动者的身体健康和安全，并提供必要的补偿和休息安排。

三、劳动者权益保护

面对可能的违法加班行为，劳动者应了解自己的合法权益，并采取必要措施进行保护：

1. 保留证据：劳动者应妥善保留加班的准确记录，如考勤数据、工作通信记录等，以便在需要时证明自己的加班情况。
2. 投诉与仲裁：如果发现用人单位存在违法加班行为，劳动者有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。劳动监察部门将依法进行调查处理，维护劳动者的合法权益。
3. 协商与沟通：在采取法律手段之前，劳动者也可以尝试与用人单位进行协商和沟通，要求其调整加班安排并支付相应的加班工资。

总结：公司加班超过36小时是否违法，需结合具体情况和法律规定来判断。在一般情况下，超时加班是违法的；但在特定的特殊情况下，如紧急处理、公共设施抢修等，超时加班可能不被视为违法。作为劳动者，应充分了解自己的权益，并在必要时采取合法手段维护自身权益。如果你有任何关于劳动工伤方面的法律问题，都可以直接向我咨询。