国企员工休病假超过三个月，并不意味着劳动合同一定会被解除。这一问题的答案取决于多个因素，包括医疗期的长度、员工的实际病情、以及是否存在可以解除劳动合同的法定情形。以下是对这一问题的详细分析：

一、医疗期的规定

根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，员工享有医疗期，具体期限根据工作年限确定。例如，实际工作年限10年以下的，在本单位工作5年以下的为3个月；5年以上的为6个月。在医疗期内，企业不得随意解除劳动合同。这意味着，如果员工的医疗期尚未结束，即使病假已经超过三个月，企业也不能单方面解除劳动合同。

二、医疗期满后的处理

1. 若员工在医疗期满后仍不能从事原工作：根据《劳动合同法》第四十条的规定，若员工在规定的医疗期满后不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作，用人单位可以依法解除劳动合同。但需提前三十日以书面形式通知员工本人，或者额外支付员工一个月工资后，方可解除劳动合同，并支付相应的经济补偿金。

2. 经济补偿金的计算：经济补偿金按劳动者在本单位工作的年限，以每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。若用人单位未提前三十日通知而直接解除劳动合同，则需支付上述经济补偿金的两倍作为赔偿金。

三、特殊情况下可解除劳动合同的情形

尽管病假期间通常不能解除劳动合同，但若员工存在《劳动合同法》第三十九条规定的严重过错情形，如严重违反用人单位的规章制度、严重失职、营私舞弊给用人单位造成重大损害等，用人单位可以依法解除劳动合同，且无需支付经济补偿。这些情形包括但不限于：

• 在试用期间被证明不符合录用条件的；
• 严重违反用人单位的规章制度的；
• 严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害的；
• 劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的；
• 因《劳动合同法》第二十六条第一款第一项规定的情形致使劳动合同无效的；
• 被依法追究刑事责任的。

四、法律建议

1. 了解医疗期规定：员工应了解自己的医疗期长度，以便在病假期间维护自己的合法权益。
2. 保留相关证据：在病假期间，员工应保留好医疗证明、病假条等相关证据，以备不时之需。
3. 及时沟通：若员工在医疗期满后仍不能从事原工作，应及时与用人单位沟通，了解用人单位的安排和补偿方案。
4. 寻求法律援助：若员工认为用人单位在病假期间违法解除劳动合同，可以寻求法律援助，维护自己的合法权益。

总结来说，国企员工休病假超过三个月并不意味着劳动合同一定会被解除。是否解除劳动合同取决于医疗期的长度、员工的实际病情以及是否存在可以解除劳动合同的法定情形。员工应了解自己的权益和法律规定，以便在必要时维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。