公务员病假期间的工资扣除依据主要来源于《关于国家机关工作人员病假期间生活待遇的规定》及相关政策，具体规定如下：

一、病假在2个月以内（不含公休节假日）

• 工资待遇：公务员的原工资照发，即工资收入不因病假而减少，按照正常出勤时的标准全额发放。

二、病假超过2个月但不足6个月

• 工作年限10年及以下：从第3个月起，按本人标准工资的90%计发。
• 工作年限11年及以上：原工资照发，即依然按照正常的标准工资全额发放。

三、病假超过6个月

• 工作年限10年及以下：从第7个月起，按本人标准工资的70%计发。
• 工作年限11-20年：从第7个月起，按本人标准工资的80%计发。
• 工作年限21年以上：从第7个月起，按本人标准工资的90%计发。

四、特殊情况说明

1. 获得相关荣誉人员：

   • 1945年9月2日以前参加革命工作的人员，病假期间工资照发。
   • 省、市、自治区人民政府和国务院各部门授予的劳动英雄、劳动模范，以及享受省部级及以上劳动模范待遇的人员，其病假在6个月以内的，原工资照发；病假超过6个月的，从第7个月起，其病假期间工资可在相应工作年限计发病假工资基础上提高10%-15%，但最多不得超过本人原工资数额。

2. 长期病假人员：

   • 对长期病假人员，单位应根据病情积极给予治疗。经过医院证明确定不能坚持正常工作，并经任免机关批准，可办理退休（退职）手续。

五、地区差异与注意事项

• 地区差异：不同地区可能会根据当地实际情况，在国家规定的基础上出台一些具体的实施细则或补充规定。因此，实际执行时应以当地政策为准。例如，有些地区可能会根据经济发展水平、财政状况等因素，对病假工资的发放标准进行适当调整。
• 生活福利待遇：公务员在病假期间，应继续享受所在单位的生活福利待遇，如住房补贴、交通补贴等。
• 禁止有收入活动：公务员在病假期间不得从事有收入的活动，否则将停止其病假期间的工资待遇。这是为了确保公务员在病假期间能够专心休养，避免因兼职等活动影响病情恢复。
• 外地治疗或休养：若公务员在病假期间经医疗机构证明需要转外地治疗或休养，且时间较长的，可根据实际情况适当提高其病假期间的工资待遇。这是为了照顾公务员在外地治疗或休养期间可能增加的生活成本。

建议：

• 公务员在请假前应仔细了解相关政策，并按照规定提交申请和相关证明材料，如医疗证明等，以确保自己的权益得到保障。
• 如有任何疑问或需要具体了解本单位的相关规定，建议咨询所在单位的人事部门或财务部门，或者查阅相关的官方文件和政策解读。

综上所述，公务员病假期间的工资扣除依据主要与其病假时长和工作年限密切相关，并受到国家相关规定和地方政策的共同影响。在实际操作中，应综合考虑各项因素，确保公务员的合法权益得到妥善保障。