公司恶意拖欠工资是可以立案的，但具体立案途径和条件取决于实际情况和法律规定。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
一、行政程序立案：向劳动监察部门投诉
- 立案条件：劳动者需提供初步证据证明劳动关系存在及用人单位拖欠工资的事实，如劳动合同、工资条、考勤记录等。
- 处理流程：劳动监察部门接受投诉后，会依法受理并展开调查。如果调查属实，劳动监察部门会责令用人单位限期支付工资，并可能对其进行行政处罚。这属于行政程序中的立案，是劳动者维权的一种快速有效方式。
二、劳动仲裁立案：申请劳动仲裁
- 立案条件：
- 材料齐全，包括仲裁申请书、身份证明、劳动合同等证明劳动关系的材料，以及工资拖欠的证据。
- 有明确的仲裁请求、事实和理由。
- 在仲裁时效内（一般为一年，从知道或应当知道权利被侵害之日起计算）。
- 属于劳动仲裁受案范围，如企业与劳动者之间的工资争议。
- 处理流程：劳动仲裁机构审查申请后，若符合条件则立案受理，并进行裁决。如果用人单位不履行裁决，劳动者还可以向法院申请强制执行。
三、司法程序立案：向法院起诉
劳动争议诉讼：
- 立案条件：对劳动仲裁结果不服，需在收到仲裁裁决书之日起十五日内提起诉讼，并符合民事诉讼法的起诉条件。
- 处理流程：法院经审查后，若符合立案条件则受理，并进行审理判决。如果用人单位不履行判决，劳动者可以申请强制执行。
直接起诉（特殊情况）：
- 适用情形：用人单位给劳动者出具了工资欠条，且不涉及劳动关系其他争议。
- 立案条件：法院审查符合立案条件，如欠条真实有效，劳动者诉求明确。
- 处理流程：法院直接受理并审理案件，根据欠条等证据判决用人单位支付工资。
四、刑事案件立案：针对恶意拖欠
- 立案条件：
- 拒不支付一名劳动者三个月以上的劳动报酬且数额在五千元至二万元以上，或拒不支付十名以上劳动者的劳动报酬且数额累计在三万元至十万元以上。
- 用人单位以转移财产、逃匿等方法逃避支付劳动报酬，或有能力支付而不支付。
- 经政府责令支付仍不支付。
- 处理流程：劳动行政部门调查处理后，若用人单位逾期不支付，可能移送公安机关立案侦查，依法追究刑事责任。这是针对恶意拖欠工资行为的最严厉处罚。
注意事项与建议
- 及时收集证据：劳动者在遇到拖欠工资情况时，应及时收集相关证据，如劳动合同、工资条、考勤记录等，以证明劳动关系存在及用人单位拖欠工资的事实。
- 选择合适维权途径：根据自身情况和实际需求，选择合适的维权途径。如果拖欠工资数额不大且情况明确，可以考虑向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁；如果拖欠工资数额较大或情况复杂，可以考虑向法院起诉或寻求刑事立案。
- 保持沟通与协商：在维权过程中，保持与用人单位的沟通与协商，尝试通过和解或调解解决争议。这有助于节省时间和成本，并维护良好的劳动关系。
综上所述，公司恶意拖欠工资是可以立案的，但具体立案途径和条件取决于实际情况和法律规定。劳动者应充分了解自身权益和维权途径，积极维护自己的合法权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。