结论：二审询问庭只来一个法官，但庭审笔录上记录为三个法官，这种情况是否合法，需根据实际庭审情况及法律规定综合判断，但通常而言，若实际参与庭审的法官与笔录记录不符，可能存在程序瑕疵或违规。

分析说明：

1. 二审合议庭的组成：

   • 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》及相关司法解释，二审法院审理案件时，应当组成合议庭进行。合议庭由审判员组成，或者由审判员和人民陪审员共同组成，具体人数根据案件性质和法律规定确定，但通常为三人以上单数。
   • 在二审询问庭（或称为庭审）中，合议庭成员应当全部出席，共同参与庭审过程，包括听取当事人陈述、审查证据、进行法庭辩论等。

2. 庭审笔录的记录：

   • 庭审笔录是记录庭审过程的重要法律文书，应当准确、完整地反映庭审的实际情况，包括合议庭成员的出席情况、当事人的陈述、证据的出示与质证、法庭辩论的内容等。
   • 庭审笔录需要由合议庭成员、书记员以及当事人签名或盖章确认，以确保其真实性和合法性。

3. 实际出席与笔录记录不符的问题：

   • 如果二审询问庭实际只来一个法官，但庭审笔录上却记录为三个法官，这明显与庭审的实际情况不符。
   • 这种情况可能由于笔录记录错误、合议庭成员未全部出席但笔录被篡改或伪造、或者存在其他程序瑕疵或违规行为导致。

4. 合法性判断：

   • 从合法性的角度来看，如果实际参与庭审的法官与笔录记录不符，这违反了庭审的公开、公正原则，也可能损害当事人的合法权益。
   • 当事人有权对庭审过程提出异议，并要求法院对庭审笔录进行更正或补充。如果法院拒绝更正或补充，当事人可以向上一级法院申诉或申请再审。

行动建议：

• 核实庭审情况：首先，你需要核实二审询问庭的实际出席情况，包括是否有其他法官通过视频会议等方式参与庭审（尽管这种情况较为罕见，且通常会在笔录中明确记录）。
• 要求更正笔录：如果确认实际只来一个法官，但笔录记录错误，你可以向法院提出书面申请，要求更正庭审笔录，确保笔录的真实性和合法性。
• 考虑申诉或再审：如果法院拒绝更正笔录，或者你认为这种情况已经影响了案件的公正审理，你可以考虑向上一级法院申诉或申请再审，以维护自己的合法权益。

最后，如果你在二审过程中遇到任何法律问题或疑虑，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见和帮助。