当中标结果被质疑时，是否能签合同需根据质疑的性质、影响及法律规定来判断。一般而言，在质疑处理期间应暂停签订合同，以避免潜在的法律风险和纠纷。但在某些特殊情况下，如质疑缺乏依据或涉及紧急情况，经相关部门批准并采取风险防范措施后，仍可签订合同。以下从不同角度进行详细分析：
一、法律规定与原则
《中华人民共和国招标投标法》第四十六条：明确规定了招标人和中标人应当自中标通知书发出之日起三十日内，按照招标文件和中标人的投标文件订立书面合同，且不得再行订立背离合同实质性内容的其他协议。这一条款强调了合同签订的时限和内容要求，但并未直接涉及质疑情况下的合同签订问题。然而，结合其他相关法规，可以推断出在质疑处理期间签订合同可能不符合法律精神。
《中华人民共和国招标投标法实施条例》第五十七条：进一步强调了合同内容与招标文件、投标文件的一致性，并指出在质疑处理期间签订合同可能影响质疑处理的公正性和有效性。这一条款实际上为质疑处理期间的合同签订设置了限制。
《中华人民共和国政府采购法实施条例》第五十四条：明确规定，询问或质疑事项可能影响中标结果的，采购人应当暂停签订合同。这一条款直接针对质疑情况下的合同签订问题，为招标人提供了明确的法律指引。
二、特殊情况下的合同签订
质疑缺乏依据：若质疑方提出的质疑缺乏事实或法律依据，经过审查确认中标结果合法有效，招标人在向质疑方作出合理回应后，可与中标人签订合同。例如，质疑仅基于主观猜测而无实质性证据支持的情况。但在此情况下，招标人仍需谨慎处理，确保质疑已得到充分回应和解决，以避免后续纠纷。
紧急情况：对于某些特殊的紧急项目，如抢险救灾、疫情防控等，因时间紧迫，延迟签订合同可能导致公共利益受损或项目无法正常进行。在此类情况下，招标人可经过相关主管部门的批准，并采取必要的风险防范措施后，与中标人签订合同。但这一做法需严格遵循相关法律法规和程序要求，确保合法合规。
三、实际操作建议与注意事项
及时处理质疑：招标人应对质疑事项进行及时、公正的判定，评估其对中标结果的可能影响。若认为质疑可能成立或财政部门要求暂停，应立即暂停合同签订流程，以避免潜在的法律风险和纠纷。
保持沟通解释：在等待质疑处理期间，招标人与中标人应保持密切沟通，及时澄清和解释相关问题，以消除误解和疑虑。这有助于为后续的合同签订打下良好基础，减少不必要的纠纷和延误。
确保合同一致性：在签订合同时，必须确保合同内容与招标文件和中标人的投标文件完全一致，不得进行任何实质性修改。这是维护招标公正性和合同法律效力的关键所在。
采取风险防范措施：在特殊情况下决定签订合同时，招标人应充分考虑潜在的法律风险和纠纷，采取相应的风险防范措施。例如，可以增加违约责任条款、设立履约保证金等，以降低合同履行过程中的风险。
综上所述，中标被质疑后的合同签订问题需根据具体情况灵活处理。在遵循法律规定和原则的基础上，结合实际情况和风险防范措施，做出合理的决策。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。