贪污5000元在多数情况下是可以立案的，且通常会按照贪污罪进行立案追诉。以下是从不同角度的详细分析：

一、立案标准与法律依据

根据《中华人民共和国刑法》第三百八十二条及第三百八十三条的规定，贪污罪是指国家工作人员利用职务上的便利，侵吞、窃取、骗取或者以其他手段非法占有公共财物的行为。关于贪污罪的立案标准，虽然法律并未直接规定具体的数额界限，但司法实践中通常会参考相关司法解释及地方规定。一般来说，贪污数额在三千元至一万元以上的，应认定为“数额较大”，并达到刑事立案标准。因此，贪污5000元在多数地区已经超过了这一标准，可以立案。

同时，需要注意的是，各省、自治区、直辖市可能会根据本地区的经济社会发展状况和治安形势，对贪污罪的立案标准做出具体规定。但即便如此，5000元在绝大多数地区都已远超“数额较大”的最低标准，因此立案的可能性很大。

二、立案后的处理流程

一旦贪污案件被立案，公安机关或检察机关将依法开展全面的侦查工作。这包括但不限于勘查现场、调查相关人员、收集证据以及查找犯罪嫌疑人等。若案件得以侦破，贪污者将面临严厉的刑事处罚，如有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金。具体量刑会由法院综合考虑犯罪情节、犯罪分子的认罪态度、退赃退赔情况等多种因素后作出决定。

三、特殊情形的处理

1. 贪污数额接近立案标准但未达到：

   • 在某些特殊情况下，如果贪污数额接近但未达到立案标准，但存在其他严重情节，如贪污手段恶劣、造成严重后果等，司法机关仍可能依法立案追诉。

2. 贪污未遂或中止：

   • 如果贪污行为因意志以外的原因未能得逞（未遂）或主动放弃（中止），虽然可能不构成贪污罪的既遂，但司法机关仍可能根据具体情况进行立案调查，并依法处理。

3. 共同贪污中的个别数额认定：

   • 在共同贪污案件中，如果各犯罪嫌疑人共同贪污的数额达到立案标准，但个别犯罪嫌疑人分得的数额较小，司法机关仍可能对整个案件进行立案追诉，并根据各犯罪嫌疑人在共同犯罪中的作用和分得的数额进行量刑。

四、建议与注意事项

1. 增强法律意识：

   • 作为国家工作人员，应时刻牢记自己的职责和使命，增强法律意识，遵守法律法规，不要触碰法律的底线。

2. 及时报案与配合调查：

   • 如果发现贪污行为或自己成为贪污行为的受害者，应及时向公安机关或检察机关报案，并积极配合警方的调查工作，以维护自身的合法权益和社会秩序的稳定。

3. 了解法律程序与规定：

   • 在报案前或涉及贪污案件时，建议了解相关的法律程序和规定，以便更好地维护自己的合法权益和配合司法机关的工作。

综上所述，贪污5000元在多数情况下是可以立案的，并且一旦立案，将可能面临严重的法律后果。因此，我建议广大民众要增强法律意识，遵守法律法规。如果你有任何关于贪污罪或其他经济犯罪、刑事辩护方面的法律问题，都可以直接向我咨询。