农业设施用地不备案是否算违建，不能一概而论，需根据具体情况和当地法律法规进行综合分析。以下是对此问题的详细解读：

一、农业设施用地的定义与用途

农业设施用地是指用于农产品生产、加工、存储等农业相关活动的土地，包括种植设施用地、养殖设施用地以及配套设施用地。这类用地的使用应严格遵循相关规定和程序，以确保土地的合理利用和保护土地资源。

二、备案的性质与重要性

备案是规范土地使用、确保土地合理利用的重要措施。对于农业设施用地，许多地区确实存在备案的要求。未按照要求进行备案，可能会被视为不符合相关规定，但并不一定直接构成违建。不过，不备案仍属于程序上的瑕疵，相关部门可能会要求当事人及时补办备案手续。

三、不备案可能不被认定为违建的情形

1. 符合设施农业发展规划和用地标准：

   • 若农业设施严格用于农业生产，且符合当地的农业发展规划布局、规模标准和相关技术规范要求，如养殖设施需符合养殖规模和防疫要求，种植大棚需符合农业种植的合理布局，则即使未备案，一般也不宜直接认定为违建。

2. 不涉及改变土地性质和用途：

   • 使用的必须是农用地，且未破坏耕地的耕作层，未改变土地的农业用途。例如，临时性农产品保鲜仓储设施的建设，若未将土地用于非农业建设，则即使未备案，也不构成违建。

四、可能被认定为违建的情形

1. 违反土地利用总体规划：

   • 若农业设施建设的位置、规模等与当地的土地利用总体规划相冲突，如在基本农田保护区内违规建设农业设施，则即使未备案，也可能被认定为违建。

2. 擅自改变土地用途：

   • 以农业设施为名，实际上将该用地用于非农业建设，如建设永久性住宅、商业用房等，则无论是否备案，均构成违建。

3. 严重破坏耕地：

   • 在建设农业设施过程中，对耕地造成了严重破坏，导致耕地无法继续进行农业生产，如大量取土、挖砂等行为，则即使未备案，也可能被认定为违建。

五、法律后果与建议

• 法律后果：一旦被认定为违建，可能面临责令限期改正、拆除甚至罚款等处罚。
• 建议：
  1. 及时备案：在使用农业设施用地前，务必了解并遵守当地的相关规定和程序，及时进行备案，以避免程序上的瑕疵。
  2. 合规使用：确保农业设施的建设和使用符合当地的农业发展规划、用地标准和相关技术规范要求，不擅自改变土地用途或破坏耕地。
  3. 咨询专业意见：如遇相关问题或不确定是否合规，建议直接向我咨询，以获取准确的法律意见和帮助，确保建设行为的合法性和合规性。

综上所述，农业设施用地不备案是否算违建，需根据具体情况和当地法律法规来判断。务必确保农业设施的建设和使用符合相关规定和要求，以避免不必要的法律风险和经济损失。