职务侵占罪主要由公安机关负责立案侦查，但具体情形需根据犯罪主体的身份和性质来进一步确定。以下是对此问题的详细分析：

一、一般情况下的立案机关

1. 公安机关：在大多数情况下，职务侵占罪由公安机关的经济犯罪侦查部门（经侦部门）负责立案侦查。当公司、企业等单位发现员工存在职务侵占行为，并掌握了足够的证据（如合同、账目记录、聊天记录等）证明犯罪事实达到立案标准时，可直接向犯罪行为发生地或犯罪嫌疑人居住地的公安机关报案。公安机关在接到报案后，会对提交的材料进行审查，若认为有犯罪事实需要追究刑事责任，将会予以立案侦查。

2. 立案流程：

   • 报案或举报：受害人或相关知情人向公安机关的经侦部门报案或举报，提供详细的案情描述、相关证据材料以及嫌疑人的基本信息等。
   • 初步审查：公安机关接到报案后，对案件进行初步审查，判断是否符合立案条件，包括核实报案人身份、了解案情经过、收集相关证据等。
   • 立案决定：如果经审查认为存在犯罪事实且需要追究刑事责任，公安机关会作出立案决定，并启动侦查程序。
   • 侦查取证：在侦查过程中，公安机关会依法收集、调取各种证据材料，包括物证、书证、证人证言、被害人陈述、嫌疑人供述和辩解等，用于后续的起诉和审判工作。

二、特殊情况下的立案机关

对于国有公司、企业或其他国有单位中从事公务的人员，以及由这些单位委派到非国有单位从事公务的人员，若他们实施职务侵占行为，则可能按照贪污罪处理。此时，应向监察机关（如人民检察院）举报，而非公安机关。这是因为这些人员具有特殊的身份和职责，其职务侵占行为可能涉及更严重的违法犯罪，需要由专门的监察机关进行调查和处理。

三、注意事项

1. 证据收集：在报案前，公司应尽可能收集全面、客观的证据材料，以证明犯罪事实的存在和犯罪嫌疑人的身份。这些证据材料对于公安机关的立案侦查和后续的起诉审判工作都至关重要。
2. 报案途径选择：对于不同性质的单位（如国有与非国有）和人员（如公务人员与非公务人员），其职务侵占行为的法律性质和立案机关可能有所不同。因此，在报案前，公司应充分了解相关法律法规和程序要求，确保选择正确的报案途径。

总结与建议：职务侵占罪的立案与处理是一个涉及多个法律环节和机关的复杂过程。公司、企业在面对此类问题时，应充分了解相关法律法规和程序要求，确保报案的准确性和有效性。同时，在处理过程中，如果遇到任何疑问或困难，都可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议和帮助。