指定遗产管理人的程序主要依据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定进行，以下是一个清晰、详细且具有深度的解答：
一、申请指定遗产管理人的途径
当对遗产管理人的确定存在争议时，利害关系人可以向被继承人死亡时住所地或者主要遗产所在地的基层人民法院提出申请，要求指定遗产管理人。这一申请应当以书面形式提出，即提交申请书，申请书中需要明确写明被继承人死亡的时间、申请事由以及具体请求，并附上被继承人死亡的相关证据。
二、法院的审查与指定
受理申请：人民法院在收到申请后，会进行审查核实，确保申请符合法律规定的条件。
指定原则：法院在指定遗产管理人时，会遵循有利于遗产管理的原则，综合考虑各种因素，如遗产的性质、数量、分布情况，以及潜在继承人的利益等。
判决指定：经过审查核实后，法院会作出判决，指定合适的遗产管理人。这个判决是具有法律效力的，被指定的遗产管理人需要依法履行其职责。
三、遗产管理人的职责与变更
职责：被指定的遗产管理人需要依法履行遗产管理职责，包括但不限于遗产的清点、保管、处置等。同时，遗产管理人还需要遵循公正、公平的原则，确保遗产的处置结果符合所有利害关系人的利益。
变更情形：如果被指定的遗产管理人死亡、终止、丧失民事行为能力或者存在其他无法继续履行遗产管理职责的情形，人民法院可以根据利害关系人或者本人的申请，另行指定新的遗产管理人。
撤销资格：如果遗产管理人违反其职责，严重侵害继承人、受遗赠人或者债权人的合法权益，人民法院可以根据利害关系人的申请，撤销其遗产管理人资格，并依法指定新的遗产管理人。
四、特殊情况下的指定
在某些特殊情况下，如没有利害关系人提出申请或者利害关系人之间无法达成一致意见时，人民法院也可以依职权直接指定遗产管理人。此外，在普通诉讼程序中，如果涉及遗产管理的问题，人民法院也可以追加民政部门等作为被告或第三人，并在必要时指定其担任遗产管理人。
五、民政部门担任遗产管理人的情况
以宁夏地区为例，根据《民政部门担任遗产管理人工作参考》的规定，民政部门不能自行主动担任遗产管理人，而是必须经由人民法院依法指定。这通常发生在利害关系人向法院提起指定遗产管理人特别诉讼，或者人民法院依职权直接指定的情况下。民政部门在担任遗产管理人时，需要严格遵照民法典、民事诉讼法的相关规定，建立全闭环工作体系，确保遗产处置的公正公平。
综上所述，指定遗产管理人的程序是一个涉及多个环节和法律规定的复杂过程。如果您或您身边的人遇到相关问题，建议及时咨询专业律师或相关机构以获取更具体的法律帮助。