公司扣工资是否合法，需根据具体情况判断。在符合法律法规和规章制度的前提下，某些扣除是合法的；而无正当理由或超出法定范围的扣除则是非法的。以下从合法与非法两个角度，为您详细分析：

合法扣工资的情形

1. 代扣代缴法定款项：

   • 公司可以依法代扣代缴员工的个人所得税、社会保险费用（如养老保险、医疗保险等个人负担部分）、住房公积金以及其他法律、法规规定的应由员工个人负担的费用。这是公司的法定义务，扣减行为合法。

2. 依据合法有效的规章制度：

   • 如果公司通过民主程序制定了合法有效的规章制度，并且这些制度已向员工公示或告知，那么公司在员工违反规章制度时，有权按照制度规定扣除相应工资。例如，员工旷工或迟到早退达到制度规定的次数，公司可按规定扣除相应工资。但需注意，罚款的金额和方式必须合理，不能侵犯员工的合法权益。

3. 员工给公司造成经济损失：

   • 若员工因故意或重大过失给公司造成经济损失，公司可以要求员工赔偿，并可从其工资中扣除赔偿费用。但每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。

4. 绩效不达标：

   • 在绩效考核制度公平、公正且明确规定的情况下，如果员工的绩效工资被判定为不达标，公司可以合法扣减其绩效工资。

非法扣工资的情形

1. 规章制度未经法定程序制定：

   • 如果公司的扣工资制度没有经过民主程序制定，也没有向员工公示或告知，那么该制度对员工不具有约束力。公司依据这样的制度扣减员工工资是不合法的。

2. 扣工资损害员工基本权益：

   • 公司随意克扣工资，导致员工工资低于当地最低工资标准，或者扣除工资的行为严重影响员工基本生活，均属于非法行为。

3. 缺乏合理依据的扣工资：

   • 公司没有合理、明确的理由，仅凭主观判断就扣减员工工资，也是不合法的。这种行为侵犯了员工的劳动报酬权。

4. 扣除比例过高或剩余工资低于最低标准：

   • 如因员工过错导致损失而扣除工资时，扣除比例超过月工资20%或扣除后剩余工资低于当地最低工资标准，均构成违法。

维权途径

如果员工认为公司扣减工资的行为不合法，可以采取以下措施来维护自己的权益：

1. 与公司沟通协商：首先尝试与公司进行沟通，要求公司说明扣减工资的依据并提供相应证据。

2. 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，员工可以向当地的劳动监察部门投诉，由其对公司的扣减行为进行调查和处理。

3. 申请劳动仲裁：如果投诉仍未解决问题，员工可以依法向劳动仲裁机构申请仲裁，以维护自己的合法权益。

总结来说，公司扣工资是否合法，需综合考虑扣工资的具体原因、公司制度的合法性以及是否遵守了相关法律法规。在任何情况下，公司都应遵守相关法律法规，确保员工的合法权益得到保障。而员工在遭遇不合法扣减时，也应积极采取措施维护自己的权益。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。