小区内私自种花的行为，通常涉及物业管理、城市绿化管理以及可能的城市管理等多个方面，具体由哪个部门或主体来管理，需根据实际情况来判断。以下是从不同角度进行的分析：
一、物业管理公司的角色与职责
管理依据：物业管理公司依据与业主签订的物业服务合同，负责小区公共区域的环境维护。业主手册、物业服务合同等通常会明确规定，业主不得擅自占用公共区域或改变其用途，这自然也包括不得私自种花占用公共绿地。
管理措施：一旦发现私自种花行为，物业管理公司有权进行劝阻和制止，要求业主停止侵权行为并恢复原状。若业主拒不配合，物业可进一步向相关部门报告，并保留通过法律途径追究责任的权利。
二、城市绿化行政主管部门的监管职责
管理依据：根据《城市绿化条例》等相关法律法规，任何单位和个人不得擅自占用城市绿化用地或改变其使用性质。小区内的公共绿地，作为城市绿化的一部分，同样受到这些法规的保护。
管理措施：城市绿化行政主管部门负责监管和查处违规占用绿化用地的行为。对于私自种花占用公共绿地的行为，该部门有权责令限期改正、恢复原状；情节严重的，还可能处以罚款等行政处罚。
三、城管部门的介入与管理
管理依据：依据地方城市管理相关法规，城管部门负责管理影响城市容貌和环境卫生的行为。小区作为城市的一部分，其环境秩序同样受到城管部门的关注。
管理措施：若私自种花行为影响了小区的整体美观和秩序，城管部门有权依法制止和纠正。对于拒不改正的，城管部门可采取强制措施，如移除花卉，并根据规定对责任人进行处罚。
四、处理流程与建议
初步反映：业主或居民发现私自种花行为时，应首先向物业公司反映情况，由物业公司进行调查和处理。
物业处理：物业公司应根据物业服务合同和相关规定，对私自种花行为进行劝阻和制止。若无法解决问题或存在争议，物业公司应向城市绿化行政主管部门或城管部门报告。
行政介入：在城市绿化行政主管部门或城管部门接到报告或投诉后，应及时进行调查处理，根据违规行为的严重程度采取相应的管理措施。
法律救济：若因私自种花行为引发邻里纠纷或造成损失，相关方可通过法律途径寻求救济，如向法院提起诉讼，要求侵权人承担民事责任。
总结来说，小区内私自种花的行为不仅违反了物业管理规定，也可能触犯城市绿化管理和城市管理的相关法律法规。因此，业主和居民应遵守相关规定，不得擅自占用公共区域或改变其用途进行种花。对于发现的私自种花行为，应通过合法途径及时向相关部门反映和处理，以维护小区的整体规划和绿化效果。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。