结论前置：公司注销后，员工能否申请劳动仲裁取决于公司注销前的清算情况、是否存在承继主体以及劳动争议的具体时效等因素。若公司未经依法清算或清算过程中存在过错，导致员工权益受损，员工有权申请劳动仲裁；反之，若公司已依法清算并妥善处理员工权益，则员工一般不能再申请劳动仲裁。
一、可以申请劳动仲裁的情况
公司注销前未依法清算
- 法律依据：根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国公司法〉若干问题的规定（二）》第十九条，若公司未经依法清算即办理法人注销登记，有限责任公司的股东、股份有限公司的董事和控股股东，以及公司的实际控制人需对公司债务承担相应赔偿责任。
- 具体做法：员工可将这些主体列为被申请人申请劳动仲裁，要求相关责任人支付未清偿的工资、经济补偿金等劳动债权。
清算组成员存在过错
- 法律依据：同样依据上述规定第二十三条，清算组成员在清算过程中违反法律、行政法规或公司章程给公司或债权人造成损失的，应承担赔偿责任。
- 具体做法：员工可以清算组成员为被申请人，要求其赔偿因过错导致的损失。
有承继主体
- 情况说明：若公司注销后有承继其权利义务的主体（如合并、分立后的公司），员工可将该承继主体列为被申请人申请劳动仲裁。例如，A公司被B公司吸收合并后注销，A公司的员工可与B公司解决劳动争议。
劳动争议诉讼期间公司恶意注销
- 处理方式：在劳动争议诉讼期间，若公司恶意注销以逃避债务，劳动者可变更诉讼对象，向相关主体或个人进行维权。
二、不可以申请劳动仲裁的情况
- 公司已依法清算并注销
- 情况说明：若公司在注销前已依法进行清算，并足额支付了员工工资、经济补偿金等各项费用，员工的劳动债权已得到妥善处理，此时员工再申请劳动仲裁将缺乏事实和法律依据，一般不会得到支持。
三、劳动仲裁的时效与注意事项
劳动仲裁时效
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，劳动者申请仲裁不受一年仲裁时效期间的限制；但劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出。
申请劳动仲裁的注意事项
- 提交书面仲裁申请：当事人应提交书面仲裁申请书，并按被申请人数提交副本。申请书应载明劳动者的基本信息、用人单位的信息、仲裁请求及所依据的事实、理由等。
- 准备相关证据材料：劳动者在申请劳动仲裁时应准备充分的证据材料来支持自己的主张，如劳动合同、工资条、工作记录、银行流水等。
四、实际案例与法律建议
- 实际案例：假设某公司因经营不善决定注销，但在注销前未依法进行清算，未支付员工工资和经济补偿金。员工在得知公司注销后，及时收集了劳动合同、工资条等证据，并向劳动争议仲裁委员会提交了仲裁申请，将公司的股东列为被申请人。最终，仲裁委员会支持了员工的仲裁请求，要求股东支付未清偿的工资和经济补偿金。
- 法律建议：在遇到公司注销的情况时，员工应及时收集并保存相关证据，以证明与原公司存在劳动关系以及权益受损的事实。同时，根据公司的清算状态和是否存在承继单位，确定合适的责任主体和维权途径。
总结：公司注销后员工能否申请劳动仲裁是一个复杂的问题，需要根据具体情况进行分析。如果你正面临这样的问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况，为你提供详细的法律建议和帮助。