交通事故中第三方鉴定费用的承担问题，需根据事故责任划分、保险合同约定及法律规定来综合判断。以下是对该问题的详细分析：

1. 保险公司承担

   • 交强险：根据《保险法》第六十四条，鉴定费作为确定损失程度的必要、合理费用，原则上应由保险人（即保险公司）在交强险财产损失赔偿限额内承担。
   • 商业三者险：若机动车购买了商业三者险，且保险合同对鉴定费有明确约定，则按约定执行。部分保险合同会赔付必要的、合理的鉴定费用，但也有可能将鉴定费列为间接损失不予赔偿。因此，具体是否由保险公司承担还需依据保险合同的具体条款。

2. 侵权人承担

   • 依据《中华人民共和国民法典》第一千一百七十九条，虽然法条未明确列举鉴定费，但鉴定费作为确定赔偿数额的必要合理费用，通常会被认定由侵权人承担。在交通事故中，侵权人因其侵权行为导致受害人损失，包括为确定损失程度而支出的鉴定费用，因此应承担相应的鉴定费用。

3. 双方按照责任比例分担

   • 若交通事故双方均有责任，鉴定费用通常会按照交警部门认定的责任比例进行分担。例如，若双方负同等责任，则鉴定费用可能由双方各承担一半。

4. 申请人垫付与最终承担

   • 根据《诉讼费用交纳办法》的相关规定及司法实践，“谁主张，谁预先缴纳”原则被广泛采用。即申请鉴定的一方需先垫付鉴定费用。待鉴定结果出来后，再根据事故的责任划分及上述规定，确定最终的鉴定费用承担者。

特殊注意事项：

• 重新鉴定费用：若对鉴定结果有异议并申请重新鉴定，费用承担规则为：改变原结论则由原提出鉴定方承担，未改变则由申请重新鉴定方承担。
• 协商与诉讼：若交通事故双方能协商一致，鉴定费的承担可由双方自行约定。若无法协商，需通过诉讼解决，法院将依据事故责任划分、过错程度等因素判决鉴定费的最终承担者。

举例说明： 假设在一起交通事故中，A车与B车相撞，导致B车受损。经交警部门认定，A车负主要责任，B车负次要责任。双方对车辆损失程度有争议，决定进行第三方鉴定。此时，鉴定费用通常由申请鉴定的一方（假设为B车车主）先行垫付。待鉴定结果出来后，若鉴定费用为1000元，根据责任比例，A车车主可能需承担700元，B车车主承担300元。若A车购买了交强险和商业三者险，且保险合同约定鉴定费由保险公司承担，则A车车主承担的700元可由保险公司赔付。

建议： 在处理交通事故时，为避免不必要的纠纷，建议当事人在进行交通事故鉴定前，明确鉴定费的承担问题，并尽可能通过协商或法律途径确保自身权益得到保障。若对鉴定费用承担有疑问或争议，可直接向我咨询，我将根据具体情况提供专业的法律意见。