当遇到程序违法的案件时，处理方式会根据案件的具体性质（如是否为法院案件或行政处罚案件）有所不同。以下我将分别就这两种情况为您详细阐述处理流程。

一、法院程序违法的案件处理

1. 上诉或申诉

   • 如果您对一审法院的判决或裁定不满，且认为存在程序违法，您可以在规定的上诉期内（民事案件中通常为判决后15日，裁定后10日）向上一级人民法院提起上诉。在上诉状中，您需要明确指出程序违法的具体情形，并提供相关证据支持，如庭审笔录、送达回证等。
   • 对于已生效的判决或裁定，如果您发现其中存在程序违法问题，您可以向人民法院或人民检察院提出申诉，提交申诉状及相关证据材料，要求纠正错误。

2. 申请再审

   • 如果您的案件符合法定再审情形（如审判组织不合法、应回避人员未回避等），您可以向原审或上一级人民法院申请再审。申请材料包括再审申请书、原审裁判文书及相关证据。法院将审查您的申请，如果符合条件，将裁定再审。

3. 向法院或相关机构反映情况

   • 您还可以向原审法院院长或审判监督部门反映程序违法问题，要求他们自查自纠。同时，您也可以向人民检察院反映，检察院将依法进行法律监督，可能提出检察建议或抗诉。

4. 要求国家赔偿

   • 如果法院的程序违法行为给您造成了损害（如财产损失、人身权利侵犯），您有权依法要求国家赔偿。赔偿申请应向赔偿义务机关提出，并附上相关证据材料。

二、行政处罚程序违法的案件处理

1. 申请行政复议

   • 如果您认为行政处罚决定侵犯了您的合法权益，且该处罚存在程序违法问题，您可以向作出处罚决定的行政机关的上一级机关或同级人民政府提出复议申请。复议机关将审查处罚决定的合法性，如果确认程序违法，可能撤销或变更原处罚决定。

2. 提起行政诉讼

   • 如果您对行政处罚决定不服，且认为处罚程序违法，您可以向人民法院提起诉讼。法院将全面审查处罚决定的合法性，如果认定程序违法，可判决撤销或部分撤销原处罚决定，并可能责令行政机关重新作出行政行为。

3. 请求国家赔偿

   • 如果因程序违法的行政处罚导致您的合法权益受到损害，您有权根据《中华人民共和国国家赔偿法》的规定请求国家赔偿。赔偿范围通常包括直接损失，如财产损失、人身伤害赔偿等。

4. 监督与纠正

   • 上级行政机关或监察机关如果发现下级行政机关的行政处罚存在程序违法问题，应责令其改正；情节严重的，可对相关责任人员给予处分。此外，人民法院在审理案件过程中，如果发现行政机关存在普遍性的程序违法问题，可向有关机关提出司法建议，促使其完善执法程序。

总结与建议：

面对程序违法的案件，无论是法院案件还是行政处罚案件，您都应充分了解自身权利，并采取合适的法律措施来维护自己的权益。在处理过程中，建议您保留好所有相关证据，如庭审笔录、送达回证、行政处罚决定书等，以便在需要时提供证明。同时，如果您对法律程序不熟悉，建议您咨询专业律师或法律机构，以获取更专业的指导和帮助。