单位内部考核罚款是否合法需分情况讨论，具体分析如下：

1. 若罚款依据合法且程序合规，则可能合法
   根据《劳动合同法》第四条及《企业职工奖惩条例》（已废止，但部分原则仍具参考价值），用人单位可通过民主程序制定规章制度（如考核制度），明确罚款情形、标准及程序，且需向劳动者公示。例如：

   • 罚款针对严重违反规章制度的行为（如旷工、重大过失导致损失）；
     
   • 罚款金额合理，未超过月工资的20%或当地最低工资标准；
     
   • 罚款后工资不低于最低工资标准；
     
   • 制度经职工代表大会讨论、公示，且劳动者签字确认。
     若满足上述条件，罚款可能被认定为合法，但需注意地方性法规可能对罚款有额外限制（如江苏、广东等地明确禁止企业罚款）。

2. 若罚款依据或程序违法，则不合法

   • 依据违法：若单位以“考核不达标”等非违纪行为为由罚款，或罚款条款未写入合法有效的规章制度，则属于违法克扣工资。
     
   • 程序违法：未通过民主程序制定制度、未公示、未告知劳动者，或罚款未留存书面证据（如签字确认的考核表），均可能导致罚款无效。
     
   • 金额违法：罚款后工资低于最低工资标准，或单次罚款超过月工资20%，均属违法。
     此时，劳动者可要求单位补发工资，并向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

3. 替代方案建议
   即使罚款合法，单位也可考虑更合规的管理方式，例如：

   • 将罚款改为“绩效扣分”，影响奖金而非工资；
     
   • 通过培训、调岗等方式督促改进；
     
   • 对造成损失的，依法要求赔偿（需举证损失与行为的因果关系）。
     

温馨提示：若您遇到单位考核罚款问题，建议先核对单位制度是否合法公示、罚款是否针对违纪行为、金额是否合理，并保留相关证据（如制度文本、考核表、工资条）。如有疑问，可直接向我咨询具体应对方案。