政府部门违法的监督与管理，主要由以下几个主体和机制来负责：
上级行政机关的监督：
- 根据我国的行政体制，上级行政机关对下级行政机关具有监督和管理的职责。如果发现下级政府部门存在违法行为，上级行政机关有权进行调查、纠正，并视情况给予相应的行政处分。
- 例如，如果某市政府的某个部门存在违法行为，省政府的相关部门或市政府本身（如果涉及的是市政府下属的独立部门且市政府有直接监督权）有权进行监督和处理。
行政监察机关的监督：
- 行政监察机关是专门负责监督政府机关及其工作人员行为的机构。它们有权对政府部门的违法行为进行调查，并根据调查结果提出处理建议或直接作出处理决定。
- 在我国，这一职能主要由各级监察委员会承担，它们对所有行使公权力的公职人员进行监察，调查职务违法和职务犯罪。
司法机关的监督：
- 司法机关，包括法院和检察院，也承担着对政府部门违法行为的监督职责。如果政府部门的违法行为侵犯了公民、法人或其他组织的合法权益，受害者可以向法院提起诉讼，要求法院对政府部门的违法行为进行审查并作出判决。
- 检察院则负责监督法律的执行和实施，包括监督政府部门是否依法行使职权。如果发现政府部门存在违法行为，检察院有权提出检察建议或提起公益诉讼。
社会监督与舆论监督：
- 社会公众和媒体也是监督政府部门行为的重要力量。公众可以通过举报、投诉等方式向相关部门反映政府部门的违法行为。
- 媒体则可以通过报道、曝光等方式对政府部门的违法行为进行舆论监督，促使相关部门及时纠正错误并追究责任。
针对政府部门违法的具体处理措施：
- 如果发现政府部门存在违法行为，首先可以向该部门的上级行政机关或行政监察机关进行举报或投诉。
- 如果违法行为侵犯了个人或组织的合法权益，可以向法院提起诉讼，要求法院对违法行为进行审查并作出判决。
- 在整个过程中，保持对事件的关注，并积极配合相关部门的调查和处理工作。
建议：
- 在面对政府部门违法行为时，保持冷静和理性，通过合法途径进行维权。
- 收集并保存好相关证据，以便在举报、投诉或诉讼过程中提供有力支持。
- 如有需要，可以寻求专业律师的帮助，以确保自己的合法权益得到有效维护。
政府部门违法是一个严肃的问题，需要多个主体和机制共同协作来加以解决。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。