商户乱扔垃圾的管理部门主要依据垃圾丢弃的场景和区域来确定，具体如下：
城市街道或公共场所：
- 管理部门：城市管理综合行政执法部门（城管部门）。
- 法律依据与职责：根据《城市市容和环境卫生管理条例》及相关城市生活垃圾管理办法，城管部门负责监督和管理城市市容及环境卫生。对于商户在城市街道、公共场所随意丢弃垃圾的行为，城管部门有权制止，并可依法给予罚款等处罚。例如，对于单位违规倾倒垃圾，可能面临5000元至5万元的罚款；个人则可能面临200元以下的罚款。
住宅小区或商业综合体内部：
- 管理部门：
- 物业服务企业：如果商户位于住宅小区或商业综合体内，物业服务企业通常负责该区域的环境卫生维护。根据《物业管理条例》，物业服务企业需按照合同约定提供环境卫生服务，对商户乱扔垃圾的行为进行劝阻和制止。
- 社区居民委员会或业主委员会：在物业难以解决或处理不力时，社区居民委员会或业主委员会可以介入调解，协助处理环境卫生问题。
农村地区：
- 管理部门：
- 乡镇人民政府：在农村地区，乡镇人民政府负责农村环境卫生管理工作，包括农村垃圾治理的规划和实施。对于商户在农村地区乱扔垃圾的行为，乡镇人民政府有权进行监督和管理。
- 村民委员会：村民委员会可以通过制定村规民约等方式，引导村民和商户维护村庄环境卫生，对乱扔垃圾的行为进行教育、劝阻。
法律建议：
- 如果您发现商户乱扔垃圾，首先可以尝试与商户沟通，提醒其注意环境卫生，避免乱扔垃圾。
- 如果沟通无果，您可以根据垃圾丢弃的场景和区域，选择相应的管理部门进行举报或投诉。例如，在城市街道或公共场所，可以直接联系城管部门；在住宅小区或商业综合体内，可以向物业服务企业或社区居民委员会反映；在农村地区，则向乡镇人民政府或村民委员会反映情况。
- 在举报或投诉时，建议您提供详细的垃圾丢弃地点、时间、商户信息等，以便管理部门能够迅速定位并处理问题。
可能法律后果：
- 商户乱扔垃圾的行为可能面临行政处罚，如罚款等。具体罚款金额根据垃圾丢弃的场景、数量以及当地相关法规的规定而定。
- 如果商户乱扔垃圾的行为严重影响了环境卫生或造成了其他损害，还可能面临民事赔偿等法律责任。
希望以上解答能够帮助您明确商户乱扔垃圾的管理部门及相关法律后果。如果您还有其他法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。