结论前置：协商解除劳动合同后，若存在特定情形，劳动者仍然可以申请劳动仲裁。但需注意，仲裁申请需在法定时效内提出，且双方已真实、合法地完成协商并履行完毕的情况下，一般不得再就同一事项申请仲裁。以下是对这一问题的详细分析：
可以申请仲裁的情况
存在欺诈、胁迫或乘人之危等情形
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第二十六条，以欺诈、胁迫手段或乘人之危使对方违背真实意思订立或变更的劳动合同无效或部分无效。
- 实例说明：若用人单位在协商解除劳动合同时，隐瞒了关键信息（如即将发放的奖金、未支付的加班费等），或者以不支付工资、不提供离职证明等为要挟，诱使或迫使劳动者解除合同，劳动者可以主张欺诈或胁迫，申请仲裁要求恢复劳动关系或获得相应的经济补偿。
协商解除协议未履行或未完全履行
- 法律依据：虽然协商解除劳动合同是双方自愿的行为，但如果协议中约定的义务（如支付经济补偿金、办理社保转移等）未履行或未完全履行，劳动者有权依据协议申请仲裁，要求对方履行支付义务或承担违约责任。
- 实例说明：若协议约定用人单位需支付经济补偿金但未兑现，或者未按照约定为劳动者办理社保转移手续，劳动者可以申请仲裁，要求用人单位履行协议义务。
涉及未明确协商的劳动争议事项
- 法律依据：劳动争议受案范围包括因劳动合同订立、履行、变更、解除等发生的争议。如果协商解除劳动合同时，未就某些劳动争议事项（如加班工资、未休年假补偿等）进行明确协商，劳动者离职后可以就这些事项单独申请仲裁。
- 实例说明：若协商解除劳动合同时，双方未就加班工资进行协商，劳动者离职后可以申请仲裁，要求用人单位支付加班工资。
不可以申请仲裁的情况
- 若协商解除劳动合同是双方真实意思表示，过程合法合规，且协议已明确权利义务并履行完毕，劳动者通常不得再就同一事项申请仲裁。例如，双方平等自愿协商解除劳动合同，用人单位按约支付了经济补偿金，劳动者也办理了离职手续且无其他争议声明，此时劳动者再申请额外补偿一般不会被支持。
申请仲裁的注意事项
- 时效限制：根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。因此，劳动者应在法定时效内提出仲裁申请，逾期可能因超过时效而不予受理。
- 证据收集：在申请仲裁前，劳动者应尽可能收集与争议相关的证据，如协商解除劳动合同的协议、工资支付记录、加班记录、工作证、考勤记录等，以便在仲裁过程中证明自己的主张。
- 选择正确的仲裁机构：劳动者应向劳动合同履行地或用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
实际操作建议
- 在协商解除劳动合同时，劳动者应仔细阅读协议内容，确保自己的权益得到充分保障。
- 如果对协议内容有疑问或不确定的地方，应及时向用人单位提出并寻求解答。
- 在签订协议前，最好咨询专业律师的意见，以确保协议的合法性和有效性。
- 如果发生劳动争议，且符合申请仲裁的条件，劳动者应及时向劳动争议仲裁委员会提出仲裁申请，以维护自己的合法权益。
总之，协商解除劳动合同后，劳动者在特定情况下仍然有权申请劳动仲裁。但为了确保自己的权益得到充分保障，劳动者应在协商过程中保持谨慎，并在必要时寻求专业律师的帮助。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。