没有营业执照的用人单位与劳动者发生争议时，是否可以申请劳动仲裁需视具体情况而定。以下是从不同角度的详细分析：

一、特定情形下的劳动仲裁

1. 建筑施工、矿山企业违法发包：

   • 根据《关于确立劳动关系有关事项的通知》第四条，建筑施工、矿山企业等用人单位若将工程（业务）或经营权发包给不具备用工主体资格的组织或自然人，该组织或自然人招用的劳动者，其用工主体责任由具备用工主体资格的发包方承担。
   • 结论：在此类特定情形下，劳动者可将具备用工主体资格的发包方列为被申请人，向劳动仲裁机构申请仲裁。

2. 其他类似情形：

   • 类似地，如果其他行业也存在违法发包或分包，且发包方具备用工主体资格，劳动者同样可以参照上述规定，向发包方申请劳动仲裁。

二、一般情形下的处理方式

1. 劳务关系或雇佣关系：

   • 若用人单位未取得营业执照，通常双方形成的是劳务关系或雇佣关系，而非劳动关系。
   • 结论：此时，劳动者不能直接通过劳动仲裁程序解决纠纷，但可以根据《劳动争议调解仲裁法》的相关规定，通过向人民法院提起民事诉讼的方式，要求无营业执照的用人单位或其出资人支付劳动报酬、赔偿因工作受到的损害等。

2. 证据的重要性：

   • 无论是否属于特定情形，劳动者能否申请劳动仲裁的关键在于能否提供充分的证据证明与用人单位之间存在实际劳动关系。
   • 建议：劳动者应收集并保存所有可能证明劳动关系存在的证据，如工作证、服务证、工资条、考勤记录、社保缴费证明、同事证言等。

三、具体操作建议

1. 确认劳动关系及被申请人身份：

   • 劳动者应首先尝试确认与用人单位之间的劳动关系，并查询并确认被申请人的身份。若公司无营业执照，劳动者可前往当地工商管理局查询并复印用人单位的企业法人登记基本资料。
   • 注意：如果用人单位未注册成立，劳动者应以实际的雇主、投资人或负责人等作为被申请人。

2. 准备劳动仲裁申请材料：

   • 劳动者需准备劳动仲裁申请书、身份证明以及证据材料。证据材料应包括证明劳动关系的证据和证明仲裁请求的证据。
   • 提示：所有材料应提供复印件，并保留原件以备查。

3. 向劳动仲裁机构提交申请：

   • 劳动者应将准备好的仲裁申请书及相关证据材料提交到有管辖权的劳动争议仲裁委员会，并特别说明用人单位没有营业执照的情况。
   • 等待：劳动仲裁机构会在规定时间内对申请进行审查，并决定是否受理。如果材料不齐，可能会要求补充材料。

4. 参与劳动仲裁的审理和裁决：

   • 一旦受理，仲裁委员会会通知双方当事人，并安排仲裁庭组成人员。劳动者需要清晰、准确地阐述自己的主张和证据。
   • 结果：仲裁庭经过审理后，会根据事实和法律规定作出裁决。如果劳动者胜诉，而被申请人拒绝履行裁决，劳动者可以向法院申请强制执行。

四、特殊注意事项

1. 主体资格问题：

   • 被诉企业若未取得营业执照，则不具备合法的用工主体资格，与劳动者建立的并非传统意义上的劳动关系，而更趋近于劳务关系。
   • 影响：此类纠纷可能不属于传统劳动争议范畴，主流劳动争议仲裁机构可能无权受理。此时，劳动者仍可选择向当地劳动监察部门提出投诉。

2. 法律咨询与帮助：

   • 在整个劳动仲裁过程中，劳动者应密切关注仲裁机构的通知和要求，确保按时参加庭审等程序。
   • 支持：如有需要，劳动者可以直接向我咨询，以获取更具体的法律建议和帮助，确保自身权益得到充分保护。

综上所述，没有营业执照的用人单位与劳动者发生争议时，劳动者是否可以申请劳动仲裁需根据具体情况判断。在特定情形下，劳动者可以向具备用工主体资格的发包方申请劳动仲裁；在一般情形下，劳动者则可能需要通过向人民法院提起民事诉讼来维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。