施工单位中标后自己进行清标，在符合一定条件下是合法的。以下是对这一问题的详细分析：
一、清标的定义与目的
清标，通常指的是在招标投标活动中，由招标人或招标代理机构在开标后、评标前，对投标文件进行初步审查，以识别出投标文件中可能存在的错误、遗漏或不符合招标文件要求的内容，并据此进行必要的澄清、说明或补正。清标的目的是确保评标工作的顺利进行，提高评标效率，保障招标投标活动的公平、公正和公开。
二、施工单位自己清标的合法性分析
法律未明确禁止：
- 目前，我国的相关法律法规并未明确禁止施工单位在中标后自己进行清标。清标行为本身并不直接涉及违法或违规，关键在于清标的过程和结果是否符合法律法规和招标文件的要求。
符合招标文件要求：
- 如果招标文件明确允许或未禁止施工单位自己进行清标，并且施工单位在清标过程中严格遵守了招标文件的规定，那么这种清标行为就是合法的。
不损害其他投标人利益：
- 施工单位在清标过程中应确保不损害其他投标人的合法权益。如果清标行为导致其他投标人的利益受损，如通过清标修改了自己的投标报价或技术方案等，那么这种行为就可能构成违法或违规。
透明公正：
- 清标过程应保持透明和公正，确保所有投标人都能在同等条件下参与竞争。如果施工单位在清标过程中存在不公正行为，如偏袒自己或歧视其他投标人，那么这种行为也是不合法的。
三、施工单位自己清标的注意事项
严格遵守招标文件：
- 施工单位在进行清标时，应仔细阅读招标文件，确保清标过程和结果完全符合招标文件的要求。
保持透明公正：
- 清标过程应公开透明，确保所有投标人都能了解清标的进展和结果。同时，施工单位应避免在清标过程中进行任何可能损害其他投标人利益的行为。
及时沟通与澄清：
- 如果在清标过程中发现投标文件存在错误、遗漏或不符合招标文件要求的内容，施工单位应及时与招标人或招标代理机构进行沟通，并根据需要进行必要的澄清、说明或补正。
记录清标过程：
- 施工单位应详细记录清标的过程和结果，以备后续查验和审计。这有助于证明清标行为的合法性和合规性。
四、可能的法律后果
如果施工单位在清标过程中违反了法律法规或招标文件的规定，可能会面临以下法律后果：
- 投标被否决：如果清标行为导致投标文件不符合招标文件的要求，招标人可能会否决该投标。
- 行政处罚：如果清标行为违反了相关法律法规的规定，施工单位可能会受到行政处罚，如罚款、警告等。
- 民事赔偿：如果清标行为损害了其他投标人的合法权益，施工单位可能需要承担民事赔偿责任。
建议：施工单位在中标后自己进行清标时，应确保清标过程合法、合规、透明和公正。如果对清标过程或结果存在疑问或担忧，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见。