甲方逾期付款的违约金数额需根据合同约定、法律规定及实际损失综合判断，具体分为以下几种情况：

1. 合同有明确约定
   若双方签订的合同中已明确约定逾期付款违约金的计算方式（如按日万分之五支付违约金、按未付款项的20%支付违约金等），则一般以合同约定为准。但需注意：

   • 若违约金约定过高（超过实际损失的30%），违约方可依据《民法典》第585条请求法院或仲裁机构予以调减；
     
   • 若违约金约定过低（不足以弥补实际损失），守约方可请求法院或仲裁机构予以调增。

2. 合同未约定违约金
   若合同未约定违约金，但约定了逾期付款利息或其他损失赔偿方式，则按约定执行。例如：

   • 约定按LPR（贷款市场报价利率）的1.5倍支付逾期利息；
     
   • 约定赔偿因逾期付款导致的直接损失（如仓储费、停工损失等）。

3. 合同既未约定违约金也未约定损失赔偿
   若合同未作任何约定，守约方可依据《民法典》第584条主张实际损失赔偿，包括：

   • 直接损失（如资金占用期间的利息损失，可参照LPR计算）；
     
   • 间接损失（如因逾期付款导致的额外交易成本、利润损失等，但需证明损失与逾期付款的因果关系）。

实务建议：

• 签订合同时，建议明确约定逾期付款违约金的计算方式（如“按未付款项的日万分之五支付违约金，累计不超过未付款项的20%”），以降低后续争议风险；
  
• 若发生逾期付款，建议及时固定证据（如催款通知、付款记录、损失证明等），以便主张权利；
  
• 若违约金约定存在争议，可委托律师结合合同条款、交易习惯及实际损失进行综合评估，制定最优维权策略。
  

如有具体合同或案件情况，可进一步向我咨询，我会结合细节为您详细分析。