在第二次起诉离婚且男方缺席的情况下，法院的判决会依据一系列法律法规和实际情况进行综合考量。以下是对这一问题的详细解答：

一、缺席判决的法律依据

根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，若被告经传票传唤无正当理由拒不到庭，或未经法庭许可中途退庭，法院有权进行缺席判决。在离婚诉讼中，这一原则同样适用。若男方在第二次起诉离婚时缺席且无正当理由，法院将依法作出判决。

二、第二次起诉离婚的特殊性

1. 时间间隔要求：

   • 第一次起诉离婚被驳回后，原告需等待6个月才能再次起诉，这是《民法典》的明确规定。
   • 第二次起诉时，由于双方已经历过一次诉讼，法院通常认为双方感情确已破裂的可能性较高，因此判决离婚的概率可能增加。

2. 缺席判决的条件：

   • 法院需通过合法方式（如邮寄传票、公告送达等）通知被告开庭时间和地点。
   • 被告无正当理由拒不到庭或中途退庭，这是缺席判决的前提条件。

3. 证据要求：

   • 原告需提供充分证据证明夫妻感情确已破裂，如分居证明、家暴记录、出轨证据等。
   • 若因客观原因无法自行收集证据，原告可申请法院调查取证。

三、缺席判决的具体流程

1. 立案与送达：

   • 原告向法院提交起诉状及相关证据，法院审查后立案。
   • 法院通过直接送达、留置送达、邮寄送达或公告送达等方式向被告传递诉讼材料。

2. 开庭审理：

   • 若被告未到庭，法官会核实送达情况并记录在案。
   • 原告陈述诉讼请求及事实理由，法官审查证据并进行调解（若可能）。

3. 判决结果：

   • 若调解无效且证据支持，法院将依法判决离婚，并对子女抚养权、财产分割等问题一并处理。
   • 判决书通过公告或其他方式送达被告，自送达之日起生效。

四、判决结果的考量因素

1. 夫妻感情是否确已破裂：

   • 法院会重点审查原告提供的证据，判断夫妻感情是否确已破裂。

2. 子女抚养问题：

   • 若涉及子女抚养，法院会考虑子女的最佳利益，根据子女的年龄、健康状况、父母的经济状况等因素进行裁决。

3. 财产分割问题：

   • 法院会依据《民法典》的相关规定，对夫妻共同财产进行公平分割。若男方缺席，法院会尽量保障其合法权益，为其保留应得的份额。

五、注意事项与建议

1. 确保送达有效：

   • 原告应提供被告准确的联系方式和住址，避免因送达问题导致判决效力争议。

2. 准备充分证据：

   • 原告应重点收集感情破裂的证据，如分居协议、聊天记录、报警记录等，以提高胜诉概率。

3. 关注后续执行：

   • 若判决涉及财产分割或抚养费支付，原告应在判决生效后及时申请执行。

4. 咨询专业律师：

   • 复杂案件建议委托律师代理，以确保程序合规并维护自身权益。律师可以提供专业的法律意见和诉讼策略，帮助原告更好地应对诉讼。

六、典型案例说明

假设甲第一次起诉离婚被驳回后，6个月后再次起诉。法院通过公告送达传票，乙（男方）未到庭。庭审中，甲提供了分居满两年的证据及乙长期赌博的记录。法院最终缺席判决离婚，并根据实际情况划分了共同财产。这一案例说明了在男方缺席的情况下，法院会依据原告提供的证据和法律法规进行判决。

综上所述，第二次起诉离婚且男方缺席时，法院的判决会依据法律法规、证据充分性、夫妻感情是否确已破裂、子女抚养和财产分割等多方面因素进行综合考量。因此，建议原告在处理此类案件时保持冷静和理性，积极寻求法律帮助和支持。