关于虚开运输发票罪的立案标准，这实际上与虚开普通发票罪的立案标准在核心要素上是一致的，因为运输发票通常也属于普通发票的范畴。以下是对虚开运输发票罪立案标准的详细解析：
一、立案标准的核心要素
数量或金额标准：
- 虚开发票的数量达到一百份以上，无论单张发票的金额大小，只要累计份数达到此标准，即构成立案条件。
- 虚开发票的金额累计达到四十万元以上，将每一张虚开的发票金额相加，若总额达到或超过此数额，同样满足立案要求。
行政处罚历史记录：
- 若行为人在五年内因虚开发票行为（包括但不限于运输发票）已受过两次或两次以上的行政处罚，之后再次实施虚开发票行为，无论此次的份数或金额是否达到上述标准，均应予立案追诉。这一规定体现了法律对屡教不改者的严厉态度。
其他情节严重情形：
- 除了明确的数量和金额标准外，对于那些虽然没有达到具体数量或金额标准，但情节特别严重、影响极其恶劣的虚开发票行为，如手段特别恶劣、造成重大经济损失或社会影响等，同样应予立案追诉。
二、法律依据与处罚措施
根据《中华人民共和国刑法》第二百零五条之一的规定，对于虚开本法第二百零五条规定以外的其他发票（包括运输发票），且情节严重的行为，将处以二年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处罚金。若情节特别严重，则处以二年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。对于单位犯此罪的，还将对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法进行处罚。
三、实际应用中的注意事项
- 在实际应用中，判断虚开运输发票罪是否成立，需要综合考虑发票的数量、金额、行政处罚历史以及情节严重性等多个方面。
- 虚开发票不仅涉及刑事责任，还可能对个人的声誉和信用造成严重影响，甚至影响企业的正常运营。因此，企业和个人在开具发票时务必遵守相关法律法规，确保发票的真实性和合法性。
- 法律规定可能会随着时间和实际情况的变化有所调整，因此具体案件应以最新的法律法规及司法解释为准。
四、建议与总结
对于企业和个人而言，务必严格遵守相关法律法规，避免触碰法律红线。在开具运输发票时，应确保发票的真实性和合法性，避免虚开发票等违法行为的发生。如遇到相关法律问题或存在疑问，建议及时咨询专业的法律人士，以确保自身权益得到妥善保护。同时，也提醒广大企业和个人要增强法律意识，共同维护良好的税收秩序和市场经济环境。