辞退员工的经济补偿金是按照劳动者的应发工资来计算，而非实发工资或基本工资。以下是对此问题的详细解答：
一、法律依据与解析
主要法规：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法实施条例》第二十七条，劳动合同法第四十七条所述的经济补偿月工资应按照劳动者应得工资计算，这包括了计时工资、计件工资以及奖金、津贴和补贴等所有货币性收入。
- 《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条也指出，经济补偿金的计算是基于劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资，此处的“平均工资”指的是应发工资。
应发工资与实发工资、基本工资的区别：
- 应发工资：是劳动者在正常提供劳动的情况下，用人单位应支付的全部劳动报酬，包括基本工资、奖金、津贴、补贴等，是在任何税费和其他扣款之前的总额。
- 实发工资：是劳动者实际收到的工资，即应发工资扣除个人所得税、社会保险费个人缴纳部分、住房公积金个人缴纳部分以及其他可能的扣款（如迟到罚款等）后的净额。
- 基本工资：通常是劳动者收入的一部分，指底薪或固定工资，不包括奖金、津贴等变动部分。
为何采用应发工资计算：
- 应发工资能更全面、真实地反映劳动者的收入状况，因为它包含了所有货币性收入。
- 实发工资由于扣除了多项费用，不能准确体现劳动者的完整收入情况，因此不适合作为经济补偿金的计算基础。
- 基本工资只是劳动者收入的一部分，若仅以此计算，将无法全面补偿劳动者因失去工作而遭受的经济损失。
二、具体计算示例
假设员工小张每月基本工资5000元，加上奖金500元和各项补贴300元，那么他的应发工资为5800元。若当月扣除个人所得税100元、社保个人缴纳部分300元、住房公积金个人缴纳部分500元，其实发工资为4900元。在辞退计算经济补偿时，应以5800元（应发工资）为准，而非4900元（实发工资）或5000元（基本工资）。
三、特殊情况处理
月工资高于当地职工月平均工资三倍的情况：
- 如果劳动者的月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资的三倍，那么经济补偿的标准将按职工月平均工资三倍的数额支付，且支付年限最高不超过十二年。
工作不满十二个月的情况：
- 对于工作不满十二个月的劳动者，应按照其实际工作的月数来计算平均工资，并以此为基础计算经济补偿。
违法辞退的情况：
- 如果用人单位违法辞退员工，即没有合法的理由辞退员工，那么用人单位应当按照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。
四、法律建议
了解自身权益：
- 劳动者在面临辞退时，应了解自己的经济补偿权益，确保用人单位按照应发工资计算经济补偿金。
保留相关证据：
- 劳动者应保留好与用人单位签订的劳动合同、工资条、奖金发放记录等相关证据，以便在需要时证明自己的收入情况。
及时咨询与维权：
- 如果劳动者对用人单位的计算方式有疑问或认为自己的权益受到侵害，应及时向我咨询或寻求其他法律途径的帮助，以维护自己的合法权益。
综上所述，辞退员工的经济补偿金是按照劳动者的应发工资来计算的。这一规定既符合法律法规，也能更全面地保障劳动者的权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。