社保费用不可以全部从员工工资里扣除，这种做法是不合法的。以下从不同角度为你详细分析：
法律规定层面 根据我国《社会保险法》以及相关劳动法规的规定，社会保险费用是由用人单位和劳动者共同承担的。具体来说，养老保险、医疗保险和失业保险，这三种险是由企业和员工共同缴纳的；工伤保险和生育保险则完全由企业承担，个人不需要缴纳。因此，用人单位将社保费用全部从员工工资中扣除，显然违反了法律规定，侵犯了劳动者的合法权益。
实际操作层面 在实际操作中，用人单位应当按照规定的比例，分别计算并代扣代缴员工应承担的社保费用部分，同时承担自己应缴纳的部分。如果用人单位试图通过全部从员工工资中扣除社保费用的方式来减轻自己的负担，这种做法不仅无法得到法律的支持，还可能面临劳动监察部门的处罚，以及需要承担补缴社保费用、支付滞纳金等法律责任。
员工权益保护层面 对于员工来说，如果发现用人单位存在将社保费用全部从工资中扣除的情况，应当及时向用人单位提出异议，并要求用人单位按照法律规定进行缴纳。如果用人单位拒绝改正，员工可以向当地的劳动监察部门投诉，或者通过法律途径来维护自己的合法权益。