工厂安排员工工作12小时是否违法，不能一概而论，关键在于是否遵循了《中华人民共和国劳动法》等相关法律法规的规定。以下是对此问题的全面分析：
一、一般情况下，工厂安排员工工作12小时可能违法
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第三十六条，国家实行劳动者每日工作时间不超过8小时、平均每周工作时间不超过44小时的工时制度。
- 同时，该法第四十一条规定，因生产经营需要延长工作时间的，需与工会和劳动者协商，且一般每日不得超过1小时；特殊原因下延长工作时间每日不得超过3小时，但每月不得超过36小时。
分析：
- 工厂安排员工每日工作12小时，明显超出了法律规定的正常工作时间和加班时长限制，除非符合特殊情形下的例外规定（如下文所述），否则构成违法。
- 长时间的工作可能会损害劳动者的休息权益和身体健康，与劳动法的立法目的相悖。
二、特殊情况下，工厂安排员工工作12小时可能不违法
协商一致且符合加班时间限制：
- 条件：工厂因生产经营的临时性、季节性需要，在与工会和劳动者协商后，可安排每日工作12小时，但需确保加班时间不超过法定限制（每日不超过3小时，每月不超过36小时），并依法支付加班工资（平时加班支付不低于工资的150%的工资报酬）。
- 实例：如食品加工厂在春节期间因订单量激增，经协商后安排员工在特定时间段内每日工作12小时，且依法支付加班费，未超过法定加班时间限制，则为合法。
特殊行业或工作岗位的例外规定：
- 条件：对于交通、铁路、邮电、航空、渔业等特殊行业，因其工作性质和生产特点的特殊性，可能无法严格按标准工作时间执行。这些行业可申请不定时工作制或综合计算工时工作制，但需经劳动行政部门批准。
- 实例：航空公司飞行员因航班任务不确定性，难以按标准8小时工作制执行。经劳动行政部门批准后，实行不定时工作制，飞行员根据航班任务安排工作12小时，则为合法。
三、违法行为及法律后果
- 若工厂未经协商、未支付相应加班工资，或不符合特殊行业相关规定而安排员工工作12小时，则违反劳动法规定。
- 法律后果：
- 工厂可能面临劳动监察部门的处罚，包括责令改正、罚款等。
- 员工有权向劳动监察部门投诉举报，或通过劳动争议仲裁机构维护自己的合法权益，要求工厂支付加班工资、经济补偿等。
四、总结与建议
- 工厂应严格遵守劳动法规定：在安排员工工作时，应充分考虑工作时间的合理性、加班的协商与补偿机制，以及特殊行业的特殊规定。
- 员工应了解自己的权益：遇到违法行为时，及时寻求法律援助，通过合法途径维护自己的权益。
- 建议工厂与员工加强沟通：在安排加班时，应充分与员工沟通，确保员工了解加班的原因、时长和补偿标准，避免产生不必要的纠纷。
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