结论前置：补偿金不合理但已签字，仍然有可能通过仲裁寻求合理调整，不过这取决于协议签订时的具体情况及后续的法律操作。以下从不同角度为你详细分析：

一、可以申请仲裁的情形

1. 存在可撤销情形
   • 重大误解：假如签署协议时，你对关键内容，像补偿金的计算方式、包含项目等存在重大误解，导致最终拿到的补偿不合理。比如，本应包含加班费、奖金等项目的补偿金，在计算时却遗漏了，而你在不知情的情况下签了字。这种情况下，根据《中华人民共和国民法典》相关规定，你有权申请撤销该协议，并重新确定合理的补偿。
   • 显失公平：要是协议内容明显偏向一方，使得双方权利义务严重失衡。例如，公司以极低的补偿金额打发你，而这个金额远远低于你应得的补偿标准，你处于明显不利的地位，此时你就有权申请仲裁。
   • 欺诈、胁迫或乘人之危：在签署过程中，若公司存在欺诈行为，比如故意隐瞒重要信息，让你误以为补偿金额合理而签字；或者采用胁迫手段，如以不签字就不给离职证明等威胁你；又或者利用你当时处于困境，比如急需用钱、生病等，迫使你接受不合理的补偿协议。在这些情况下，你作为受损害方有权撤销协议并申请仲裁。
2. 协议内容违法：如果补偿协议违反了法律法规的强制性规定，比如协议中约定的补偿标准低于当地最低工资标准等，那么该协议无效。此时，你当然可以就争议事项向仲裁机构申请仲裁。
3. 协议履行过程中的违约：若协议签订后，公司违反约定，比如没有按照协议约定的时间和方式支付补偿金，你可以根据协议中的仲裁条款（如有）提起仲裁，要求公司履行协议或承担违约责任。

二、可能面临的不利因素

1. 协议的法律效力：如果协议是双方真实意思表示，内容合法且不存在上述可撤销情形，那么协议具有法律效力。在这种情况下，仲裁机构可能会认定双方应依约履行，驳回你调整补偿金的请求。
2. 举证困难：要证明协议存在重大误解、显失公平、欺诈、胁迫或乘人之危等情形，需要提供充分的证据。例如，要证明公司存在欺诈行为，可能需要提供相关的聊天记录、邮件等书面证据，或者证人证言。如果证据不足，仲裁机构可能无法支持你重新确定补偿金的请求。
3. 放弃仲裁权利：如果协议中明确约定了双方放弃仲裁解决争议的权利，且该约定合法有效，那么你可能无法再就补偿金问题申请仲裁，只能通过诉讼等其他途径解决。

三、建议与操作指南

1. 仔细审查协议条款：在签订补偿协议前，一定要详细阅读并理解所有条款，特别是关于补偿金数额和支付方式的约定。如果有不明白的地方，要及时向公司询问清楚。
2. 及时行使撤销权：一旦发现协议存在可撤销情形，应在知道或应当知道撤销事由之日起一年内行使撤销权。超过这个期限，撤销权就会消灭。
3. 积极收集证据：为支持你的仲裁请求，要积极收集并保存所有相关证据，包括书面文件、通信记录、证人证言等。比如，如果公司存在胁迫行为，要尽量保留相关的录音、录像等证据。
4. 向我咨询：面对复杂的法律问题，你可以直接向我咨询，我会为你提供准确的法律意见和指导，帮助你更好地维护自己的合法权益。

总之，补偿金不合理但已签字是否能仲裁，需要综合考虑多种因素。在处理此类问题时，建议你保持冷静，仔细分析协议条款，积极收集证据，必要时寻求我的专业帮助。