在处理员工医疗期满后被公司辞退的补偿问题时，我们首先要明确的是，这涉及到合法辞退与违法辞退两种不同的情况，每种情况下的补偿标准是不同的。
一、合法辞退的经济补偿标准
如果员工在医疗期满后，确实无法继续从事原工作，也无法从事由公司另行安排的工作，那么公司有权在履行一定程序后解除劳动合同。这种情况下，公司需要按照以下标准支付经济补偿：
工作年限计算：经济补偿是按照员工在本公司的工作年限来计算的，每满一年支付一个月工资的标准。如果工作六个月以上但不满一年，也按一年计算；不满六个月的，则支付半个月工资的经济补偿。
月工资定义：这里的月工资是指员工在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资，这个平均工资是包括了基本工资、奖金、津贴等在内的。如果员工的月工资高于当地上年度职工月平均工资的三倍，那么经济补偿的标准就按照职工月平均工资的三倍来支付，且补偿的年限最高不超过十二年。
医疗补助费：除了经济补偿外，根据原劳动部的相关规定，公司还需要支付不低于六个月工资的医疗补助费。如果员工患的是重病或者绝症，医疗补助费还需要相应增加。
举例：假设员工在公司工作了5年半，月平均工资为8000元，且当地上年度职工月平均工资未超过8000元的三倍，那么经济补偿金就是5×8000 + 0.5×8000 = 44000元。同时，员工至少还可以获得6个月工资的医疗补助费，即48000元；如果患重病，则为72000元；如果患绝症，则为96000元。
二、违法辞退的赔偿金标准
如果公司没有依法解除劳动合同，比如没有充分的依据、程序违规，或者辞退了受法律保护的员工（如孕期、产期、哺乳期的女职工，以及工伤或职业病的员工），那么公司的行为就构成了违法辞退。在这种情况下，公司需要支付的赔偿金是经济补偿金的两倍。
举例：假设员工工作了3年，月均工资为6000元，如果被违法辞退，那么赔偿金就是3×6000×2 = 36000元。
三、无需支付补偿的情形
当然，也有一些情况下公司是不需要支付经济补偿的，比如员工在试用期不符合录用条件（但需要有明确的证据）、严重违反公司的规章制度（如旷工、盗窃等）、严重失职或营私舞弊给公司造成重大损失，或者被依法追究刑事责任等。
四、注意事项
程序合法性：公司在辞退员工时，需要提前30日以书面形式通知员工，或者支付代通知金，并且需要确保通知了工会。
个税处理：经济补偿金在当地职工平均工资三倍以内的部分是免税的，超出部分则需要按照个人所得税的规定来缴纳。
争议解决：如果员工对补偿金额有异议，可以向劳动仲裁机构申请仲裁，或者提起诉讼来维护自己的权益。
综上所述，辞退医疗期满员工的补偿标准需要根据具体情况来确定，公司应该严格遵循法定的程序和标准来处理，以确保员工的合法权益得到保障。同时，员工也应该了解自己的权益和可能的补偿标准，以便在必要时维护自己的权益。