结论：打架造成轻伤二级，即便双方已经和解并进行了赔偿，是否可以不起诉并非完全由双方决定，而是取决于司法机关的判断和决定。不过，和解与赔偿的情况会对案件的处理产生重要影响，有可能导致不起诉或从轻处理的结果。
分析说明：
司法机关的独立判断：
- 在刑事案件中，司法机关（包括公安机关、检察机关和法院）具有独立的判断权。即便双方已经和解并进行了赔偿，司法机关仍需根据案件的具体情况，如犯罪的性质、情节、社会危害程度等，来决定是否起诉以及如何量刑。
和解与赔偿的影响：
- 和解与赔偿是刑事案件处理中的重要情节。它们表明犯罪嫌疑人或被告人对受害人的损害进行了弥补，并表达了悔罪的态度。这有助于减轻犯罪的社会危害程度，从而可能影响司法机关的决策。
- 在实践中，如果双方能够达成和解，并且犯罪嫌疑人或被告人积极进行了赔偿，司法机关可能会考虑不起诉或从轻处理，如适用缓刑、减轻刑罚等。但这并非绝对，而是需要根据具体情况进行判断。
不起诉的条件与程序：
- 不起诉通常适用于犯罪情节轻微、社会危害不大，或者犯罪嫌疑人、被告人具有法定从轻、减轻或免除处罚情节的案件。
- 如果检察机关认为符合不起诉的条件，会经过内部审查程序后作出不起诉决定。这一决定需要综合考虑案件事实、证据、法律适用以及社会影响等多方面因素。
特殊场景：
- 如果犯罪嫌疑人或被告人有前科或累犯情况：即便双方和解并进行了赔偿，司法机关也可能因为犯罪嫌疑人或被告人的前科或累犯情况而决定起诉，并从重处罚。
- 如果案件涉及公共利益或社会影响较大：司法机关在处理时可能会更加谨慎，即便双方和解并进行了赔偿，也可能决定起诉以维护社会公正和法治秩序。
行动建议：
- 积极配合司法机关的调查与处理：如果涉及打架轻伤二级的案件，无论双方是否已经和解并进行了赔偿，都应积极配合司法机关的调查与处理工作，如实陈述事实、提供证据等。
- 寻求专业法律帮助：在处理此类案件时，建议寻求专业律师的帮助。律师可以提供法律咨询、代理诉讼等服务，帮助当事人更好地维护自己的合法权益。
法律依据：
- 《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百七十七条：犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或者有本法第十六条规定的情形之一的，人民检察院应当作出不起诉决定。对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。
- 《中华人民共和国刑法》相关条款（如第二百三十四条关于故意伤害罪的规定）以及相关司法解释，也是处理此类案件的重要法律依据。不过，具体条款的适用需根据案件具体情况进行判断。
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