职务侵占罪主要由公安机关负责立案侦查，具体来说，可以从以下几个角度详细阐述：
一、一般情况下的立案机关
公安机关的管辖权：
- 职务侵占罪作为刑事案件，其侦查工作由公安机关负责。当公司、企业等单位发现员工存在职务侵占行为，并掌握了足够的证据证明犯罪事实达到立案标准时，可直接向犯罪行为发生地或犯罪嫌疑人居住地的公安机关报案。
- 法律依据：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第十九条，刑事案件的侦查由公安机关进行，法律另有规定的除外。同时，《公安机关办理刑事案件程序规定》第十五条也明确了刑事案件由犯罪地的公安机关管辖，如果由犯罪嫌疑人居住地的公安机关管辖更为适宜的，可以由犯罪嫌疑人居住地的公安机关管辖。
立案后的处理流程：
- 公安机关在接到报案后，会对提交的材料进行审查。若认为有犯罪事实需要追究刑事责任，将会予以立案侦查。
- 若犯罪嫌疑人逃匿，公安机关在立案后将采取相应措施进行抓捕归案，以确保法律的严肃性和公正性。
二、特殊情况下的立案机关
贪污罪的特殊处理：
- 对于国有公司、企业或其他国有单位中从事公务的人员，以及由这些单位委派到非国有单位从事公务的人员，若他们实施职务侵占行为，则可能按照贪污罪处理。
- 法律依据：根据《中华人民共和国刑法》第二百七十一条，国有公司、企业或者其他国有单位中从事公务的人员和国有公司、企业或者其他国有单位委派到非国有公司、企业以及其他单位从事公务的人员有职务侵占行为的，依照贪污罪定罪处罚。此时，应向监察机关（如人民检察院）举报，而非公安机关。
自诉途径的考虑：
- 在向公安机关报案的同时，如果监管部门不受理，或者认为没有犯罪事实，或者犯罪事实显著轻微不需要追究刑事责任而不予立案的，受害人或相关单位可以考虑通过自诉途径直接向人民法院提起刑事诉讼。
三、报案时应提供的材料
- 基本材料：报案时需准备能够证明犯罪嫌疑人职务身份的材料（如劳动合同、工作证、职责说明书等）以及侵占财物的相关证据（如财务账目、银行交易记录、收据、发票、证人证言等）。这些材料应尽可能详细，以便公安机关全面了解案件情况。
四、建议与注意事项
- 及时咨询法律专业人士：职务侵占罪的立案过程涉及多个法律知识点，包括立案地点、管辖机关的确定以及报案材料的准备等。在实际操作中，建议受害人或相关单位在发现职务侵占行为后，及时咨询法律专业人士，以确保自己的合法权益得到有效维护。
- 全面收集证据：在报案前，公司应尽可能收集全面、客观的证据材料，以证明犯罪事实的存在和犯罪嫌疑人的身份。这有助于公安机关更快地立案侦查，并追究犯罪者的法律责任。
综上所述，职务侵占罪的立案机关主要是公安机关，但在特定情况下也可能涉及监察机关或人民法院。在报案时，应准备充分的证据材料，并按照法律规定的程序进行。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。