公司发现金工资是合法的，但需满足一系列条件以确保其合法性和合规性。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
法律合规性
货币形式支付：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。现金作为法定货币的一种，完全符合这一规定。
- 《工资支付暂行规定》第五条也明确指出，工资应当以法定货币支付，不得以实物及有价证券替代货币支付。这进一步确认了现金支付工资的合法性。
公司章程与内部制度：
- 虽然法律允许现金支付工资，但公司还需遵守其章程及内部规章制度。如果公司章程或相关制度明确规定了工资支付方式（如银行转账），则公司应遵循该规定，除非有充分理由并经过适当程序进行更改。
税务与财务管理
个人所得税缴纳：
- 无论工资以何种形式发放，如果工资额超过个人所得税起征点（目前为5000元/月），劳动者仍需依法缴纳个人所得税。公司作为扣缴义务人，有义务代扣代缴这部分税款。
- 现金支付工资时，公司应确保准确记录并申报员工的工资收入，以避免税务风险。
财务管理与记录保存：
- 现金支付工资可能增加企业财务管理的复杂性和成本，包括现金的保管、运输等安全风险。
- 公司应详细记录支付劳动者工资的数额、时间、领取者的姓名及签字，并妥善保存这些记录至少两年以上，以备未来可能的查询或审计。这有助于证明工资支付的合法性和合规性，降低劳动纠纷时的举证难度。
实践中的风险与应对
劳动纠纷风险：
- 在劳动纠纷中，银行转账记录是重要的证据材料。现金发放缺乏明确的支付凭证，可能增加企业在处理劳动争议时的举证难度。
- 为降低这一风险，公司应建立健全的工资支付制度，通过工资条、考勤记录等其他证据材料来辅助证明工资支付情况。
特殊情况处理：
- 若公司因特殊原因需以现金形式支付工资（如员工无银行账户、紧急支付等），应确保有充分的理由和合理的解释，并尽可能保留相关证据和记录。
- 在任何情况下，公司都不应以逃避税务、规避劳动法规等非法目的为前提来选择支付方式。
合法合规建议
优先选择电子化支付：
- 为降低潜在风险和管理成本，建议公司优先考虑通过银行转账等电子化方式支付工资。这有助于更好地接受监管并保障自身权益。
完善内部制度：
- 公司应建立完善的财务管理制度，对现金交易进行规范记录和管理。同时，在劳动合同中明确约定工资支付方式，避免后续争议。
咨询与培训：
- 公司应定期对财务和人力资源部门进行相关法律法规的培训，确保他们了解并遵守最新的税务和劳动法规要求。
- 如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，你可以直接向我提问，我会为你提供专业的解答。
综上所述，公司发现金工资在法律上是合法的，但需严格遵守相关法律法规和税务要求，确保工资的合法性和合规性。同时，公司也应关注现金支付可能带来的风险和问题，并采取有效措施加以应对和防范。