个税在交易中由买方承担是否合法，关键在于双方是否有合法有效的合同约定。如果有明确且合法的约定，买方承担个税是合法的；如果没有约定或约定不明确，则应由卖方承担个税。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据与纳税义务
根据《中华人民共和国个人所得税法》的规定，个人所得税是针对个人所得进行征收的税种，纳税义务人是取得所得的一方。在一般的交易中，如房屋买卖，卖方因转让财产取得收入，原则上应由卖方缴纳个人所得税。这是基于财产转让所得的纳税义务规定。
二、合同约定的效力
合法性：尽管税法规定了个人所得税的纳税义务人，但《中华人民共和国民法典》允许买卖双方在签订合同时，就税费的承担问题进行约定。只要这种约定是双方真实意思表示，不存在欺诈、胁迫等导致合同无效或可撤销的情形，就是有效的民事约定。这种约定并不违反法律、行政法规的强制性规定，只是对税费实际承担主体进行了重新分配。
实际操作：在实际操作中，如果买卖双方在合同中明确约定了由买方承担个人所得税，且该约定合法有效，那么买方就应当按照合同约定承担税费。此时，虽然法定纳税义务人仍然是卖方，但实际经济负担由买方承担，这并不违反法律规定。税务机关在征税时，仍会向法定纳税义务人（卖方）征收税款，但卖方缴纳后，可以依据与买方的约定，要求买方支付相应款项。
三、买方承担个税的注意事项
合同条款清晰：为避免后续纠纷，买卖双方在合同中应明确约定个税的承担方及具体金额或计算方式。例如，可以明确约定“个人所得税由买方承担，具体金额按照税务机关核定的税额支付”。
了解当地政策：不同地区的税收政策可能存在差异，买卖双方应提前了解并遵守当地的税收法规和政策。例如，某些地区可能对二手房交易中的个人所得税有特定的减免政策或计算方式。
合理定价：买方承担个税可能会增加购房成本，因此在交易前应充分考虑这一因素，并与卖方协商合理的房价。如果买方承担了个税，那么房价中应相应扣除这部分费用，以确保交易的公平性和合理性。
四、特殊情况下的税务处理
在某些特殊的交易或政策背景下，政府可能出台特定政策规定税费的承担方式。例如，在拍卖等特定交易中，个税可能由买方承担，这通常会在拍卖公告或相关文件中明确说明。此外，对于某些非典型交易或新兴业态，个税的承担问题可能需要根据具体情况进行判断和处理。在这种情况下，买卖双方应密切关注政策动态，并咨询专业律师或税务机构以确保交易的合法性和安全性。
总结来说，个税在交易中由买方承担是否合法，关键在于双方是否有合法有效的合同约定。在实际操作中，买卖双方应明确约定税费的承担方式，并了解当地的税收政策和法规，以确保交易的合法性和有效性。如果你在交易中遇到相关问题或需要进一步的法律咨询，可以直接向我提问。