关于公司对员工罚款的合法性，这确实是一个需要细致分析的问题，因为它并非一概而论地合法或不合法，而是取决于多种因素和具体条件。

首先，从一般情况来看：

自2008年《企业职工奖惩条例》废止后，我国法律并未再明确赋予用人单位对劳动者进行罚款的权力。这意味着，除非有特别的法律规定或合同约定，否则公司对员工罚款通常被视为不合法。此外，根据《劳动合同法》，公司在制定涉及劳动者切身利益的规章制度时，必须经过职工代表大会或全体职工讨论，并与工会或职工代表平等协商确定。如果公司未经此民主程序就制定包含罚款内容的规章制度，那么该规章制度是不合法的，依据其进行的罚款自然也不合法。

然而，也存在特殊情况：

如果劳动者因本人原因给用人单位造成经济损失，根据《工资支付暂行规定》第十六条，用人单位可以按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。在这种情况下，公司可以从劳动者的工资中扣除赔偿金额，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后剩余的工资不得低于当地月最低工资标准。这种扣除工资的行为是基于员工对单位造成的实际损失而承担的赔偿责任，与一般的罚款性质不同，且受到明确的扣除比例和底线限制。

对于员工来说：

如果认为公司的罚款行为不合法，首先可以尝试与公司协商解决。如果协商不成，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

总结与建议：

公司对员工的罚款行为并非绝对合法或非法，而是需要根据具体情况来判断。在大多数情况下，由于法律未赋予公司罚款权力，且公司规章制度制定程序和内容需严格遵守法律规定，因此罚款行为往往被视为不合法。但为了确保公司的正常运营和员工的合规行为，公司可以建立完善的规章制度，明确可罚款的情形、标准和程序，并确保这些规章制度不违反法律法规的强制性规定。同时，公司应加强与员工之间的沟通和交流，确保员工了解公司的规章制度和罚款政策，并定期对员工进行培训和教育，提高员工的法律意识和合规意识。在行使罚款权利时，公司应充分考虑员工的实际情况和过错程度，避免过度处罚或滥用罚款权利。