在刑事诉讼中，管辖权异议的提出时间主要依据诉讼阶段的不同而有所差异，具体如下：
审查起诉阶段：
- 犯罪嫌疑人及其辩护人可以在案件移送审查起诉后，人民检察院提起公诉前，向办理案件的人民检察院提出管辖权异议。人民检察院有义务对异议进行审查，并在受理异议后的五日以内作出决定。这一阶段提出管辖权异议，有助于确保案件在审查起诉阶段就由有管辖权的机关处理，避免后续诉讼程序中的管辖争议。
审判阶段：
- 庭前准备阶段：被告人在收到起诉书副本后的特定时间内，即提交答辩状期间内（通常为收到起诉书副本之日起10日内），可以提出管辖权异议。如果案件召开了庭前会议，被告人及其辩护人也可以在庭前会议阶段提出管辖权异议，并应当说明理由。人民法院经审查认为异议成立的，将依法处理，包括退回人民检察院或移送有管辖权的人民法院。
- 庭审阶段：在庭审过程中，当事人及其辩护人、诉讼代理人仍然有权提出管辖权异议。如果异议成立，可能会影响案件的审理进程，导致案件被移送至有管辖权的法院审理。但需注意，庭审阶段提出管辖权异议可能会打断正常的庭审程序，因此应尽量避免在此时提出，除非确实存在严重的管辖问题。
特殊情形：
- 对于反诉案件的管辖权问题，如果被告人认为受诉法院同时违反级别管辖和地域管辖规定，应当在提起反诉的同时提出管辖权异议；如果只是违反地域管辖，则应当在反诉案件答辩期间内提出管辖权异议。
- 在第二审刑事案件中，当事人一般不得以法院无管辖权为由提出管辖权异议，因为二审法院对一审法院的管辖具有上级监督关系。但如果二审法院发现一审法院确实无管辖权而审理了案件，应裁定撤销原裁判并将案件移送有管辖权的人民法院审理。
法律建议：
- 及时提出：当事人及其辩护人、诉讼代理人应密切关注诉讼程序进展，一旦发现管辖权问题，应及时在法定期间内提出异议，避免逾期丧失权利。
- 书面形式：异议应以书面形式明确提出，并详细说明异议理由和依据，以便法院进行审查。
- 准备证据：在提出管辖权异议时，应尽可能提供相关证据材料，以支持自己的异议主张。
- 关注后续处理：提出管辖权异议后，应关注法院的审查结果和后续处理情况，如有必要，可及时采取上诉等救济措施。
可能后果：
- 如果当事人未能在规定的期限内提出管辖权异议，将视为自动放弃了对管辖权提出异议的权利。此后，人民法院将不再受理其后续的管辖权异议申请，案件将继续在原法院进行审理。
- 如果法院裁定驳回管辖权异议，当事人对裁定不服的，可以在裁定书送达之日起的10日内向上一级法院提出上诉。
在刑事诉讼中，管辖权异议的提出时间是一个至关重要的法律程序问题。当事人及其辩护人、诉讼代理人应严格遵守法律规定，确保在法定期间内提出异议，以维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。