工程质保金的比例并非固定为5%或3%，而是根据具体工程类型、合同约定及法律法规要求来确定，常见比例为3%，但部分情况下可能达到5%或其他比例。以下是对此问题的详细分析：
法律法规规定：
- 根据《建设工程质量保证金管理办法》（建质[2017]138号）第七条的规定，发包人应按照合同约定方式预留保证金，保证金总预留比例不得高于工程价款结算总额的3%。合同约定由承包人以银行保函替代预留保证金的，保函金额同样不得高于工程价款结算总额的3%。这一规定为工程质保金的比例设定了上限。
实际执行情况：
- 常见比例：在实际操作中，工程质量保证金的比例通常为工程总价款的3%。这一比例既符合法律法规的要求，也能在一定程度上保障发包人的权益。例如，在一个总价款为1000万元的工程项目中，质保金通常为30万元。
- 特殊情况：对于某些特殊类型的工程项目，如基础设施工程、大型公共建筑等，由于工程风险较高，发包人可能会与承包人协商确定更高的保证金比例，如5%。但这需要双方在合同中明确约定，并且不得超过法律法规规定的上限（在此情况下，上限为工程价款结算总额的3%，但若合同双方协商一致且不违反其他法律法规，可设定为5%，不过需注意这并非普遍做法）。例如，在一个高风险的基础设施工程项目中，双方可能协商确定质保金为工程总价款的5%，即若总价款为1000万元，则质保金为50万元。
合同约定的重要性：
- 无论工程质保金的比例如何设定，最重要的是双方在合同中明确约定。合同是双方权利义务的法律依据，一旦约定明确，双方应严格按照合同执行。因此，在签订合同时，发包人和承包人应就质保金的比例、支付方式、返还条件等条款进行充分协商，并明确写入合同。
法律建议：
- 对于发包人而言，设定合理的质保金比例可以在一定程度上保障工程质量，但过高的比例可能会增加承包人的负担，影响工程的顺利进行。因此，发包人应根据工程类型、风险程度等因素综合考虑，设定合理的质保金比例。
- 对于承包人而言，应仔细审查合同中的质保金条款，确保比例合理且符合法律法规要求。同时，在工程实施过程中，应严格按照合同约定履行义务，确保工程质量符合标准，以便在质保期满后顺利收回质保金。
综上所述，工程质保金的比例并非固定不变，而是根据具体情况进行设定。在签订合同时，双方应就质保金的比例等条款进行充分协商并明确写入合同。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。