结论：公司因自身原因放假时，扣员工工资是否合法需根据具体情况判断。若放假时间在一个工资支付周期内，扣工资不合法；若超过一个工资支付周期，且员工未提供正常劳动，公司按规定支付生活费则不属于违法扣减，否则不合法。

一、一个工资支付周期内

根据《中华人民共和国劳动法》第五十条及《工资支付暂行规定》第十二条，非因劳动者原因造成单位停工、停产在一个工资支付周期内的，用人单位应按劳动合同规定的标准支付劳动者工资。这意味着，如果公司因为自身原因（如订单不足、设备检修等）安排员工放假，且放假时间未超出一个工资支付周期（通常是一个月），公司应当按照劳动合同约定的标准支付员工全额工资。例如，若员工月工资约定为5000元，公司在此周期内放假，员工应获得全额5000元工资，公司不得扣减。

二、超过一个工资支付周期

1. 员工提供了正常劳动：

   • 若放假时间超过一个工资支付周期，但员工在此期间提供了正常劳动，公司支付给员工的劳动报酬不得低于当地最低工资标准。例如，若当地最低工资标准为2000元/月，公司应至少支付员工2000元工资。

2. 员工未提供正常劳动：

   • 若员工在超过一个工资支付周期的放假期间未提供正常劳动，公司应当发放生活费。生活费标准通常参照各省、自治区、直辖市的规定执行，一般不低于当地最低工资标准的70%或按照当地的最低生活保障费标准。例如，若当地最低工资标准为2000元/月，生活费标准可能为1400元/月（即2000元的70%）。在此情况下，公司按规定支付生活费不属于违法扣减工资；若公司未按规定支付生活费，则属于违法扣减。

三、特殊情况说明

• 法定节假日放假：对于法定节假日（如元旦、春节等），公司必须按照正常出勤支付员工工资，不得扣减。
• 带薪休假：员工在带薪休假期间，工资应按照基本工资进行发放，公司不得扣减。

四、劳动者维权途径

若公司违反上述规定扣减工资，劳动者可以采取以下措施维护自己的合法权益：

1. 与公司协商：首先尝试与公司沟通，要求公司说明扣减工资的原因并提供依据，要求公司补发工资。
2. 向劳动监察部门投诉：若协商无果，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉公司的违法行为。
3. 申请劳动仲裁或提起诉讼：必要时，劳动者可以申请劳动仲裁或向法院提起诉讼，要求公司支付拖欠的工资及相应赔偿。

综上所述，公司因自身原因放假时，扣员工工资是否合法需根据具体情况判断。劳动者应了解自己的权益，并在权益受损时积极采取措施保护自己的合法权益不受侵犯。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。