结论：公司自离时，员工通常是有工资的，但具体能否拿到工资以及能拿多少，取决于多个因素。以下是对此问题的详细分析：

一、法律规定

根据《中华人民共和国劳动法》第五十条：“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。”这一规定明确了劳动者只要提供了正常劳动，无论离职方式如何，都有权获得相应的劳动报酬。此外，《工资支付暂行规定》第九条也规定，劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。

二、自离后工资的处理方式

1. 按实际出勤结算：

   • 大多数情况下，用人单位会按照劳动者实际出勤的天数来结算工资。计算公式一般为：应得工资 = 月工资 ÷ 21.75 × 实际出勤天数。其中，21.75是月计薪天数，用于将月工资折算为日工资。

2. 扣除一定费用：

   • 如果劳动合同或公司规章制度中明确规定了因劳动者旷工或自离给用人单位造成经济损失的，用人单位可以从工资中扣除相应费用。但扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。

3. 特殊情况下的处理：

   • 如果劳动者自离前未办理工作交接，导致用人单位遭受损失，用人单位可能会要求劳动者承担赔偿责任。但这并不意味着可以全额扣除工资，赔偿金额需根据实际损失和双方责任来确定。
   • 对于因自离而未能完成的工作任务或项目，如果合同中有约定，用人单位可能会根据完成情况调整最终支付的工资数额。

三、自离后如何确保拿到工资

1. 与用人单位协商：

   • 劳动者可以尝试与用人单位进行协商，了解工资结算的具体情况和时间。在协商过程中，注意保留相关证据，如聊天记录、邮件等。

2. 申请劳动仲裁：

   • 如果协商无果，劳动者可以向当地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁。在申请仲裁时，需要提供相关证据来证明自己的权益受到侵害，如劳动合同、工资条、出勤记录等。

3. 提起诉讼：

   • 对仲裁结果不满意的，劳动者还可以向人民法院提起诉讼，通过司法途径来维护自己的合法权益。

四、注意事项

• 劳动合同和公司规章制度：劳动者在入职时应仔细阅读劳动合同和公司规章制度，了解其中关于离职和工资支付的规定。
• 保留证据：在离职过程中，劳动者应保留好相关证据，如工资条、出勤记录、工作交接单等，以备不时之需。
• 及时维权：如果发现用人单位存在克扣或拖欠工资的行为，劳动者应及时采取措施进行维权，避免超过法定时效。

总结：公司自离时，员工通常是有工资的，但具体能否拿到工资以及能拿多少，取决于劳动合同、公司规章制度以及法律法规的规定。劳动者在离职前应与公司沟通协商，尽量按照法定程序和公司规定办理离职手续。如果确实存在争议，劳动者可以通过协商、投诉、仲裁或诉讼等途径来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。