建设工程合同纠纷在大多数情况下应被视为专属管辖，由不动产所在地人民法院管辖。不过，具体案件的管辖权还需根据案件性质、合同条款及相关法律法规进行综合判断。以下是对这一问题的详细分析：

一、专属管辖的法律基础

1. 法律定义：专属管辖是指法律规定某些特殊类型的案件只能由特定的法院管辖，其他法院无权管辖。
2. 法律依据：根据《中华人民共和国民事诉讼法》第三十四条的规定，因不动产纠纷提起的诉讼，由不动产所在地人民法院管辖。这一规定同样适用于建设工程合同纠纷，因为建设工程合同纠纷往往涉及不动产权益的确认、分割等物权纠纷。

二、建设工程合同纠纷专属管辖的理由

1. 便于查明案件事实：建设工程具有不可移动性，与特定土地或地理位置紧密相连。由不动产所在地法院管辖，便于法官现场调查取证，准确了解工程状况，从而作出公正裁决。
2. 便于当事人参加诉讼：不动产所在地是案件相关活动和证据集中的地方。当事人在此地诉讼，更易获取和提供证据，减少时间和经济成本。
3. 有利于判决的执行：当地法院对不动产实际情况熟悉，能更好地协调资源，确保判决执行效果，维护当事人权益。

三、管辖争议与综合分析

尽管建设工程合同纠纷通常被视为专属管辖，但在实际操作中，也存在一些争议和特殊情况：

1. 观点分歧：有观点认为，最高人民法院《关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》第二十四条规定，施工行为地为合同履行地，似乎指向一般地域管辖。然而，这一解释并未排除专属管辖的适用，而是提供了合同履行地的确定方式。结合《民事诉讼法》及《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》的规定，建设工程合同纠纷更倾向于被视为专属管辖。
2. 合同条款的影响：如果双方当事人在合同中明确约定了管辖法院或仲裁机构，并且该约定不违反级别管辖和专属管辖的规定，那么应优先按照合同约定来确定管辖。这体现了法律对当事人意思自治的尊重。

四、适用专属管辖的注意事项

1. 准确界定纠纷范围：仅与建设工程直接相关的合同纠纷才适用专属管辖。如单纯的建设工程材料买卖合同纠纷，一般不适用专属管辖。
2. 确定不动产所在地：已登记的不动产以登记簿记载为准；未登记的，以实际所在地为准。在复杂工程中，需根据具体情况确定主要不动产所在地。

五、建议

面对建设工程合同纠纷的管辖问题，建议你：

1. 仔细审查合同条款：查看合同中是否有关于管辖法院或仲裁机构的明确约定。
2. 咨询专业意见：如有需要，可以直接向我咨询，我会结合你的具体情况和法律法规，为你提供准确的法律意见和帮助。

综上所述，建设工程合同纠纷在大多数情况下应被视为专属管辖，但具体案件的管辖权还需根据案件性质、合同条款及相关法律法规进行综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。