工厂偷税漏税的处罚主要依据其违法行为的性质、情节以及造成的后果来决定，通常会涉及行政处罚和刑事处罚两个方面。以下是对工厂偷税漏税处罚的详细解答：

一、行政处罚

根据《中华人民共和国税收征收管理法》的相关规定，对于偷税漏税的工厂，税务机关会进行以下行政处罚：

1. 追缴税款：税务机关会要求工厂补缴其偷逃的税款。

2. 加收滞纳金：对于偷逃的税款，税务机关会按照规定加收滞纳金，以补偿因税款迟缴而给国家造成的损失。

3. 罚款：根据偷税漏税的情节严重程度，税务机关会对工厂处以偷逃税款一定倍数的罚款。具体来说，对于采取欺骗、隐瞒手段进行虚假纳税申报或者不申报，逃避缴纳税款数额较大并且占应纳税额百分之十以上的，税务机关会处以偷逃税款一倍以上五倍以下的罚款。

二、刑事处罚

如果工厂的偷税漏税行为构成犯罪，那么相关责任人员将面临刑事处罚。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，主要涉及以下罪名和处罚：

1. 逃税罪：

   • 纳税人采取欺骗、隐瞒手段进行虚假纳税申报或者不申报，逃避缴纳税款数额较大并且占应纳税额百分之十以上的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；
   • 数额巨大并且占应纳税额百分之三十以上的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。

2. 骗取出口退税罪（如果涉及出口退税）：

   • 以假报出口或者其他欺骗手段，骗取国家出口退税款，数额较大的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处骗取税款一倍以上五倍以下罚金；
   • 数额巨大或者有其他严重情节的，处五年以上十年以下有期徒刑，并处骗取税款一倍以上五倍以下罚金；
   • 数额特别巨大或者有其他特别严重情节的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处骗取税款一倍以上五倍以下罚金或者没收财产。

三、具体案例参考

以您提供的案例为例，重庆金轩逸进出口贸易有限公司和重庆润圆易通科技发展有限公司通过虚构出口业务、骗取国家出口退税款，被税务机关依法查处。税务机关不仅追缴了其骗取的退税款，还对其处以了罚款，并停止了其出口退税资格。同时，涉案人员也被法院依法判处有期徒刑，并处罚金。

四、建议

为了避免偷税漏税行为的发生，工厂应严格遵守税收法律法规，如实申报纳税，确保税款的及时缴纳。同时，工厂也应加强内部管理，建立健全的财务制度，防止因管理不善而导致的偷税漏税问题。

综上所述，工厂偷税漏税的处罚是严厉的，不仅涉及行政处罚，还可能涉及刑事处罚。因此，工厂应严格遵守税收法律法规，确保合法合规经营。