劳动仲裁中的工资赔偿，通常是按照劳动者的实际工资（应得工资）来计算，而非仅按底薪计算。以下是对此问题的详细分析：

一、工资构成与计算依据

1. 工资构成：

   • 员工的工资通常由基本工资（底薪）、绩效工资、奖金、津贴和补贴等部分构成。
   • 基本工资是员工正常工作时间的劳动报酬，而绩效工资、奖金等则根据员工的工作表现、业绩等因素发放。

2. 计算依据：

   • 在劳动仲裁中，工资赔偿的计算主要依据《中华人民共和国劳动法》、《中华人民共和国劳动合同法》以及相关法律法规的规定。
   • 根据这些规定，经济补偿金或赔偿金通常是按照劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资来计算的。这里的“平均工资”是指应发工资，包括计时工资或者计件工资以及奖金、津贴和补贴等货币性收入。

二、不同赔偿项目的计算方式

1. 经济补偿：

   • 根据《劳动合同法》第四十七条，经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，以每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。
   • 这里的“月工资”是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资，包括所有货币性收入。

2. 未休年假工资报酬：

   • 未休年假工资报酬的日工资收入按照职工本人的月工资除以月计薪天数（21.75天）进行折算。这里的月工资同样是指职工在用人单位支付其未休年休假工资报酬前12个月剔除加班工资后的月平均工资，包括所有货币性收入。

3. 加班工资：

   • 加班工资的计算基数一般按劳动合同约定确定，但不得低于当地最低工资标准；若无明确约定，通常按正常出勤月工资的70%计算（但这一比例可能因地区而异，且加班工资本身也属于应得工资的一部分）。
   • 在计算赔偿时，加班工资通常也会被纳入考虑范围，因为它属于劳动者应得的劳动报酬。

4. 二倍工资差额：

   • 用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同，或违反规定不与劳动者订立无固定期限劳动合同的，需每月支付二倍工资。
   • 二倍工资的基数一般以劳动者当月的应得工资为准，包括基本工资、奖金、津贴和补贴等货币性收入。

三、实际案例与分析

• 案例一：某员工因公司违法解除劳动合同而申请劳动仲裁，要求支付经济赔偿金。在计算赔偿金时，仲裁委考虑了该员工过去十二个月的平均工资，包括基本工资、绩效工资和奖金等，最终按照这一平均工资标准计算了赔偿金数额。
• 案例二：另一名员工因公司拖欠工资而申请劳动仲裁，要求支付拖欠的工资及相应的赔偿。在仲裁过程中，公司主张只按照基本工资支付拖欠的工资，但仲裁委认为应按照应得工资（包括基本工资、绩效工资等）来计算拖欠的工资数额。

四、特殊情况与处理原则

1. 试用期工资：

   • 如果劳动者在试用期内被解雇，且解雇不符合法律规定，那么赔偿金的计算基数应为试用期内的应得工资，包括基本工资和可能的绩效奖金等。

2. 最低工资标准：

   • 如果劳动者的月平均工资低于当地最低工资标准，则按最低工资标准计算赔偿金或经济补偿。

3. 地区差异：

   • 不同地区对于加班工资是否计入赔偿金的计算基数可能存在差异。一些地区认为加班工资属于正常工作时间的劳动报酬，应计入计算基数；而另一些地区则认为加班工资具有偶然性，不应计入。具体处理需参考当地司法实践。

总结与建议：

在劳动仲裁中，工资赔偿的计算通常基于劳动者的实际工资（应得工资），包括基本工资、绩效工资、奖金、津贴和补贴等所有货币性收入。因此，在申请劳动仲裁时，劳动者应尽可能提供完整的工资记录作为证据，以便准确计算赔偿金额。如果用人单位主张只按底薪计算赔偿，劳动者可以依据相关法律法规进行反驳，并寻求法律援助或咨询专业律师（即我本人）以维护自己的合法权益。