当公司部门取消导致需要辞退员工时，赔偿问题确实是一个需要细致处理的重要环节。以下是根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关法律法规，为您详细阐述的赔偿方式和计算标准：

一、合法解除且需支付经济补偿的情形

1. 条件：

   • 公司部门取消属于客观情况发生重大变化，导致原劳动合同无法继续履行。
   • 用人单位与劳动者经协商，未能就变更劳动合同内容达成一致意见。

2. 经济补偿计算标准：

   • 基本公式：经济补偿金 = 工作年限 × 月平均工资。
     • 工作年限：每满一年支付一个月工资；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资。
     • 月平均工资：指劳动者在劳动合同解除前十二个月的平均工资。若工作时间不足十二个月，则按实际月数计算平均值。
     • 最高限额：若劳动者月工资高于当地职工月平均工资三倍，补偿标准按三倍计算，且补偿年限最高不超过十二年。

3. 实例说明：

   • 假设员工甲在公司工作3年7个月，其解除合同前12个月的平均工资为8000元。由于工作年限按4年计算，因此公司应支付甲32000元（4 × 8000）作为经济补偿。

二、违法解除需支付赔偿金的情形

1. 条件：

   • 公司部门取消并非基于客观情况发生重大变化。
   • 或者公司未与员工协商即直接解除劳动合同。

2. 赔偿金计算标准：

   • 赔偿金为经济补偿标准的两倍。即按照上述经济补偿的计算方法得出的金额再乘以2。

3. 实例说明：

   • 假设员工乙在公司工作2年2个月，其解除合同前12个月的平均工资为6000元。在违法解除的情况下，乙应获得的经济补偿为15000元（2.5 × 6000），因此赔偿金为30000元（15000 × 2）。

三、无需支付补偿或赔偿的情形

• 如果员工存在《劳动合同法》第三十九条所规定的严重违反用人单位规章制度、严重失职等行为，即使因公司部门取消而解除劳动合同，公司也无需支付经济补偿或赔偿金。

四、其他相关注意事项

1. 代通知金：

   • 若用人单位未提前三十日书面通知解除合同，且不属于经济性裁员中已履行法定程序的情形，需额外支付一个月工资作为代通知金。

2. 未休年假的补偿：

   • 用人单位需按日工资收入的300%支付未休年假工资报酬，其中包含已支付的正常工资部分。

3. 争议解决途径：

   • 协商优先：建议双方通过友好协商解决分歧。
   • 劳动仲裁：若协商未果，劳动者可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
   • 诉讼救济：对仲裁结果不服的，可在法定期限内向人民法院提起诉讼。

五、建议与总结

• 在公司部门取消涉及劳动合同解除时，员工应首先与公司进行协商沟通，明确赔偿事宜。
• 若协商无果，员工可以积极寻求法律途径解决争议，如向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
• 具体的赔偿方式和金额可能因个案差异而有所不同，因此建议咨询专业律师或劳动法律机构以获得更精确的法律指导。

总之，公司在撤销部门并解除员工劳动合同时，必须严格遵守相关法律法规，确保员工的合法权益得到充分保障。同时，员工也应了解自身权利，积极维护自己的合法权益。