化工厂实行两班倒的工作制度，其合法性并非绝对，而是取决于是否满足相关法律法规中关于工作时间和休息休假的规定。以下是对此问题的详细分析：

1. 法律法规依据：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》第三十六条，国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。这是关于工作时间的基本规定。
   • 同时，该法第三十八条也明确，用人单位应当保证劳动者每周至少休息一日。这是关于休息休假的基本要求。
   • 此外，如果化工厂因生产特点不能实行上述工时制度，经过劳动行政部门批准，可以实行其他工作和休息办法，如不定时工作制或综合计算工时工作制。

2. 两班倒的具体分析：

   • 如果化工厂的两班倒制度导致劳动者每日工作时间超过八小时，或者平均每周工作时间超过四十四小时，且未经过劳动行政部门批准实行其他工作和休息办法，那么这种制度就是违法的。
   • 另一方面，如果化工厂的两班倒制度是在保证劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的前提下进行的，或者已经经过了劳动行政部门的批准，那么这种制度就是合法的。

3. 实际操作中的注意事项：

   • 化工厂在实行两班倒制度时，应确保劳动者的工作时间和休息休假符合法律法规的规定。
   • 如果因生产需要确实需要延长工作时间，应依法支付加班费，并保障劳动者的身体健康和休息权益。
   • 化工厂还应建立健全的工时管理制度，确保劳动者的工时记录真实、准确，以便在发生争议时提供证据。

4. 法律后果：

   • 如果化工厂的两班倒制度违反了法律法规的规定，劳动者有权向劳动行政部门投诉或提起劳动仲裁，要求化工厂改正违法行为并支付相应的赔偿。
   • 化工厂还可能面临劳动行政部门的处罚，如罚款、责令改正等。

建议：化工厂在实行两班倒制度前，应仔细研究相关法律法规的规定，确保制度的合法性。同时，还应加强与劳动者的沟通，确保劳动者对工时制度有充分的了解，并保障劳动者的合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。