对于营运车辆超员20%未达50%的情况，处理措施会依据车辆的具体类型（如营运客车、校车或其他营运载客汽车）而有所不同。以下是根据相关法律法规整理的详细处理方案：

一、营运客车（不含公共汽车）、校车超员处理

1. 罚款：

   • 根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十二条，若公路客运车辆或校车载客超过额定乘员20%未达50%，将面临五百元以上二千元以下的罚款。

2. 扣分：

   • 依据最新的《道路交通安全违法行为记分管理办法》，此类行为将一次记9分。

3. 其他行政后果：

   • 公安机关交通管理部门会扣留机动车，直至违法状态消除，以确保道路交通安全。
   • 若运输单位的车辆存在超员情形，并经处罚后仍不改正，对直接负责的主管人员将处二千元以上五千元以下罚款。

二、其他营运载客汽车超员处理

1. 罚款：

   • 同样按照《中华人民共和国道路交通安全法》第九十二条，若其他营运载客汽车载人超过核定人数20%未达50%，也将面临五百元以上二千元以下的罚款。

2. 扣分：

   • 根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》，此类行为将一次记3分。

3. 其他行政后果：

   • 与营运客车和校车相同，公安机关交通管理部门会扣留机动车至违法状态消除。
   • 运输单位若存在屡教不改的情况，直接负责的主管人员同样会面临罚款。

三、额外注意事项

• 可能的附加措施：根据当地的交通管理规定和执法情况，驾驶营运车辆超员还可能面临如暂扣车辆、停运整顿等其他行政后果。
• 刑事责任风险：若因超员引发重大交通事故并构成犯罪，驾驶员将依法被追究刑事责任，这可能包括吊销驾驶证、有期徒刑等严重后果。

四、法律建议

为了自身和他人的安全，请务必严格遵守交通规则，避免超载运营。超员不仅危及道路交通安全，还可能导致严重的法律后果。如需了解更多关于交通法规的信息，建议查阅最新的法律法规文件或咨询专业的法律人士，以确保您的运营活动合法合规。

综上所述，营运车辆超员20%未达50%的处理措施包括罚款、扣分以及可能的车辆扣留和其他行政后果。请务必重视并遵守相关法律法规，确保行车安全。