公司只交三险是不合法的。根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国社会保险法》的相关规定，用人单位和劳动者必须依法参加社会保险，并缴纳由养老保险、医疗保险、生育保险、失业保险和工伤保险组成的社会保险费，这通常被统称为“五险”。以下是对这一问题的详细分析：

一、社会保险的强制性

社会保险制度是我国社会保障体系的重要组成部分，具有强制性。用人单位必须为在职职工缴纳完整的五险，这是国家法律明确规定的，旨在全面保障劳动者在面临年老、疾病、工伤、失业、生育等风险时，能够依法从国家和社会获得物质帮助的权利。

二、各项社会保险的作用

1. 养老保险：为劳动者在达到法定退休年龄且累计缴费满规定年限后，提供按月领取养老金的待遇，确保其基本生活需求得到满足。
2. 医疗保险：在劳动者生病或受伤需要就医时，提供医疗费用的报销，减轻其经济负担。
3. 生育保险：针对女职工生育或实施计划生育手术时，提供医疗费用报销和生育津贴等保障，确保其生育权益得到维护。
4. 失业保险：在劳动者失业期间，符合条件的可以领取失业保险金，以及享受相关就业服务，帮助其尽快重新就业。
5. 工伤保险：当劳动者在工作过程中遭受意外伤害或患职业病时，提供医疗救治和经济补偿，保障其合法权益。

三、公司只交三险的违法性

公司只交三险（通常指养老保险、医疗保险和失业保险）而忽略了生育保险和工伤保险的缴纳，是违反国家强制性社会保险政策规定的。这种行为不仅损害了劳动者的合法权益，也破坏了社会保险制度的公平性和可持续性。

四、劳动者的权益保护

如果公司只交三险，劳动者有权采取以下措施来维护自己的合法权益：

1. 与公司沟通：首先，劳动者可以与公司进行积极沟通，了解其未缴纳全部险种的具体原因，并要求公司尽快补缴缺失的险种。
2. 投诉举报：若沟通无果，劳动者可以依法向当地的劳动监察部门投诉举报，由劳动监察部门对公司进行调查处理。
3. 申请仲裁：劳动者还可以选择向劳动争议仲裁机构申请仲裁，通过法律途径来维护自己的合法权益。

五、法律后果

如果用人单位未按时足额缴纳社会保险费，社会保险费征收机构将责令其限期缴纳或补足。逾期未缴的，将面临欠缴数额一倍以上三倍以下的罚款。此外，如果因此导致劳动者单方面解除劳动合同，劳动者还有权要求用人单位支付经济补偿。

总结与建议：公司只交三险是不合法的行为，劳动者应依法要求公司补缴缺失的险种或向相关部门投诉举报以维护自身权益。如果遇到此类问题，建议劳动者及时与公司沟通并保留好相关证据，以便在必要时通过法律途径来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。