综合计算工时工作制是一种特殊的工时制度，其核心在于以周、月、季、年等为周期综合计算工作时间，主要适用于因工作性质特殊或受季节、自然条件限制而需连续作业的行业。以下是对该制度的详细法律规定解析：

一、主要法律依据

1. 《中华人民共和国劳动法》：

   • 第三十六条：国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度（需注意，此处与后续提及的每周不超过40小时存在历史修订差异，但实践中多以每周40小时为标准，且综合计算工时制下平均周工作时间应与法定标准基本相同）。
   • 第三十八条：用人单位应当保证劳动者每周至少休息一日。
   • 第三十九条：企业因生产特点不能实行本法第三十六条、第三十八条规定的，经劳动行政部门批准，可以实行其他工作和休息办法，这为综合计算工时工作制提供了法律基础。

2. 《关于企业实行不定时工作制和综合计算工时工作制的审批办法》：

   • 第五条：详细列举了可实行综合计算工时工作制的职工类型，如交通、铁路、邮电等行业中需连续作业的职工，以及地质勘探、建筑等受季节和自然条件限制的行业的部分职工。
   • 第六条：强调了企业应确保职工的休息休假权利，并采用集中工作、集中休息等方式来平衡工作与休息。

二、具体规定与实施要点

1. 适用对象与条件：

   • 综合计算工时工作制主要适用于特定行业中的特定职工，这些职工因工作性质或环境条件限制，无法按照标准工时制度进行工作。

2. 计时方法与周期：

   • 企业可根据实际情况选择周、月、季、年等作为综合计算工作时间的周期。
   • 在综合计算周期内，平均日工作时间和平均周工作时间应与法定标准工作时间基本相同，即每日不超过8小时，每周不超过40小时（基于法定标准工作时间调整后的理解）。
   • 年工作日通常为250天（365天减去104天休息日和11天法定节假日），据此可计算出季工作日和月工作日，用于综合计算工时。

3. 加班费支付标准：

   • 在综合计算周期内，如果劳动者的实际工作时间超过法定标准工作时间，超出部分应视为延长工作时间，并按照不低于劳动合同规定的劳动者本人小时工资标准的150%支付加班费。
   • 在法定休假日安排劳动者工作的，应按照不低于劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的300%支付工资报酬。
   • 加班费计算公式：
     • 延长工作时间加班费：\(加班费 = 超出小时数 \times 小时工资标准 \times 150\%\)
     • 法定节假日加班费：\(加班费 = 工作小时数 \times 小时工资标准 \times 300\%\)（或按日工资标准计算，若按日工作8小时折算）

4. 休息休假保障：

   • 企业应依据《劳动法》的相关规定，确保职工享有足够的休息休假时间。
   • 可通过灵活的工作安排方式，如轮休调休、弹性工作时间等，来满足职工的实际需求。
   • 对于以年为周期的企业，可采取年度内集中放假等形式作为休息时间，但全年月平均工作时间不得超出法定标准工作时间。

三、审批程序与监管

1. 审批程序：

   • 企业实施综合计算工时工作制须经过严格的审批流程，包括向劳动行政部门提出申请，说明具体工种或岗位、计算周期、休息休假办法等事项。
   • 劳动行政部门会对企业的申请进行审核，批准后方可合法实行。不同地区对审批的具体要求和流程可能有所差异。

2. 监管与法律责任：

   • 劳动行政部门有权对用人单位执行综合计算工时制的情况进行监督检查，确保其遵守相关法律法规。
   • 如用人单位违反相关规定，劳动行政部门可责令其改正，并根据情节轻重处以罚款等处罚。劳动者权益受到侵害时，可通过劳动仲裁等途径维护自身合法权益。

总结与建议：

综合计算工时工作制是一种旨在适应特定行业和岗位工作特性的工时制度。企业在实施时，必须严格遵守相关法律法规，确保职工的合法权益得到充分保障。同时，企业应根据自身实际情况和职工需求，合理安排工作时间和休息休假，以促进企业的和谐稳定和持续发展。如果您在综合计算工时工作制的实施过程中遇到任何法律问题或困惑，欢迎直接向我咨询，我将为您提供专业的法律解答和帮助。