微信发工资本身不直接构成违法，但其合法性需根据具体情况判断。以下是对此问题的详细分析：
合法性前提
双方协商一致：
- 若用人单位与劳动者明确同意通过微信发放工资，并且能确保支付信息的清晰准确（如金额、时间、领取人等），则此方式在法律上通常被允许。这尤其适用于小型企业、创业公司或特定行业中的灵活支付需求。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十条，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。若劳动合同中明确约定了微信作为工资支付方式，则该行为合法。
符合支付规定：
- 微信支付作为一种电子支付方式，技术上满足货币支付的要求。只要微信转账满足货币支付的本质要求，且不违反其他相关法律法规，即可视为合法支付方式。
- 注意：虽然《工资支付暂行规定》要求用人单位以货币形式按月支付给劳动者本人，但并未明确排除微信等电子支付方式。
临时应急处理：
- 在特殊情况下，如公司财务系统故障或银行转账受阻时，为确保员工按时收到工资，经与员工沟通并说明情况后，采用微信方式应急发放工资，这种做法通常也是被允许的。
潜在问题与风险
举证困难：
- 若双方未明确约定工资发放方式为微信转账，一旦发生争议，劳动者可能面临举证困难。微信记录虽可作为证据，但与银行转账相比，在证明款项性质（明确为工资）方面可能较弱。
- 建议：在微信转账留言或聊天记录中注明“工资”用途，并妥善保存相关聊天记录、转账截图等证据。
税务风险：
- 无论通过何种方式发放工资，企业都应如实申报并缴纳税款。微信发工资需确保税务申报的合规性，避免逃税嫌疑。
- 注意：用人单位应依法履行代扣代缴个人所得税等义务，确保社保、个税缴纳基数准确。
金融监管与财务管理：
- 频繁且大额的微信工资支付可能引起金融监管部门的关注，违反金融管理规定。同时，微信转账的随意性和非正式性不利于企业的财务管理和税务申报。
- 建议：企业应建立完善的财务制度，对工资支付进行规范管理和记录，并优先选择通过对公账户发放工资。
合法合规性建议
明确合同约定：
- 在签订劳动合同时，双方应明确约定工资支付方式（包括微信支付）、支付时间等关键条款，以确保双方权益得到保障。
选择对公账户：
- 为确保税收及社保的合理处理，公司应优先选择通过对公账户发放工资。若确实需要通过微信等电子支付方式发放工资，也应确保相关操作的合规性和可追溯性。
增强法律意识：
- 劳动者也应关注自己的工资支付方式，确保权益得到保障。在签订劳动合同时，应明确工资支付方式及相关条款。
法律咨询与合规审查：
- 在采用任何非传统工资支付方式前，建议企业咨询专业法律意见，进行合规性审查，以防范潜在的法律风险。
总结：微信发工资在双方协商一致、符合支付规定且能确保支付记录准确性和可追溯性的前提下是合法的。然而，为避免潜在的法律风险和管理问题，建议企业优先考虑通过银行转账等正式渠道发放工资，并完善相关财务管理制度。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。