结论：夜班上12个小时，在一般情况下是不合法的，但特定情况下可能合法，需依据具体工时制度和行业特性来判断。

一、一般情况下的不合法性

1. 违反每日工作时间规定：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》第三十六条，国家实行劳动者每日工作时间不超过8小时、平均每周工作时间不超过44小时的工时制度。夜班上12个小时，显然超出了这一法定限制，属于延长工作时间。

2. 违反加班时间规定：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》第四十一条，用人单位因生产经营需要延长工作时间的，需与工会和劳动者协商，且一般每日不得超过1小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下，每日不得超过3小时，每月不得超过36小时。夜班上12个小时，很可能超过了法律允许的加班限度。

二、特殊情况下的合法性

1. 实行特殊工时制度：

   • 不定时工作制：适用于因生产特点、工作特殊需要或职责范围无法按标准工作时间衡量的职工，如企业高级管理人员、外勤人员等。若用人单位经批准对夜班岗位实行不定时工作制，则工作12小时可能符合规定。但需注意，实行不定时工作制需要经过劳动行政部门的审批，未经审批不得擅自采用。
   • 综合计算工时工作制：以周、月、季、年等为周期综合计算工作时间，但平均日工作时间和平均周工作时间应与法定标准基本相同。在此制度下，某一天工作12小时可能是允许的，只要整个周期内的平均工作时长不超过法定标准。同样，实行综合计算工时工作制也需经劳动行政部门审批。

2. 特殊行业或紧急情况：

   • 在医疗、餐饮、安保等特殊行业，由于行业特性和工作需要，可能存在较长时间的工作情况。但即便如此，用人单位也需确保劳动者的休息和健康权益不受侵害，并依法支付加班费。
   • 在发生自然灾害、事故等紧急情况时，为威胁劳动者生命健康和财产安全而需要紧急处理，此时延长工作时间不受《劳动法》第四十一条的限制。但这种情况较为特殊，且需确保劳动者的身体健康和安全。

三、法律后果与劳动者权益保护

• 如果用人单位未经批准擅自实行夜班12小时的工作制度，或未依法支付加班费，劳动者有权向当地劳动监察部门投诉举报，或通过劳动仲裁等途径维护自己的合法权益。
• 劳动监察部门将责令用人单位改正违法行为，并可根据受侵害的劳动者人数，对用人单位处以罚款。
• 劳动者在法定节假日或休息日被安排工作时，应获得相应的工资报酬。若用人单位未依法支付，劳动者同样有权要求支付并寻求法律保护。

建议：作为劳动者，应了解自己的权益和用人单位的工作制度。如果认为用人单位的工作时长安排违法或未依法支付加班费，应及时与用人单位沟通协商或向相关部门投诉举报。同时，用人单位也应严格遵守相关法律法规，确保劳动者的休息和健康权益不受侵害。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。