已归档的案件处理通常涉及多个方面，具体处理方式会根据案件的性质、类型以及相关法律法规的规定而有所不同。以下是一些一般性的处理原则和步骤，供您参考：

一、案件归档的基本条件

在案件归档前，需要确保案件已经符合结案条件。这通常包括：

1. 案件已经移送管辖或终止调查；
2. 决定不予行政处罚或行政处罚决定已经执行完毕；
3. 行政处罚决定终结执行或已经依法申请人民法院或人民政府强制执行；
4. 涉及需要移送有关部门追究刑事责任、党纪政务责任的，结案前应当已经依法移送。

二、案件归档的材料准备

在案件归档时，需要准备一系列完整的材料，这些材料通常包括但不限于：

1. 案件来源材料、立案（不予立案）呈批表；
2. 证据材料、调查报告、审理记录；
3. 案件处理决定呈批表、行政处罚告知书、当事人陈述申辩材料等；
4. 行政处罚决定书或行政处理决定、党纪政务处分决定等相关法律文书；
5. 案件结案呈批表以及其他需要归档的材料。

所有归档的材料应当合法、完整、真实、准确，文字清楚，日期完备，并保证归档材料之间的有机联系。

三、已归档案件的具体处理

1. 经济利益处理：

   • 对于违纪行为所获得的经济利益，如财物及其孳息收益，应当收缴或者责令退赔。
   • 责令退赔的财物应直接退赔原所有人或原持有人，无法退赔的上缴国库。

2. 其他利益处理：

   • 对于违纪行为所获得的职务、职级、职称、学历、学位、奖励、资格等其他利益，应当由承办案件的纪检机关或者由其上级纪检机关建议有关组织、部门、单位按照规定予以纠正。

3. 配合后续工作：

   • 结案后，如果有关部门需要开展与本案相关的强制执行、刑事责任、党纪政务责任追究等工作，并需要自然资源主管部门或其他相关部门配合的，这些部门应当予以积极配合。

4. 档案保存与管理：

   • 案卷资料归档应当按照档案管理要求统一归档保存或交本部门档案室保存。
   • 归档的案卷应当标注总页码和分页码，加盖档号章，并按照结论、决定、裁决性文件在前，依据性材料在后的原则进行排列组卷。

四、特殊情况处理

• 对于违纪后下落不明的党员、党组织作出处分决定前死亡的党员，或者死亡之后发现曾有严重违纪行为的党员，如果经调查确属其实施违纪行为获得的利益，也应当依照上述规定处理。

综上所述，已归档的案件处理需要遵循相关法律法规的规定，确保案件处理的合法性、公正性和有效性。同时，也需要做好档案的保存与管理工作，以便后续查阅和参考。如果您在处理已归档案件时遇到具体问题或需要进一步的法律指导，建议咨询专业的法律人士或相关机构。